Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX3

TMEM208, Transmembrane protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM208Q9BTX3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM208Q9BTX3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM208Q9BTX3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM208Q9BTX3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM208Q9BTX3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM208Q9BTX3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM208Q9BTX3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM208Q9BTX3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM208Q9BTX3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM208Q9BTX3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM208Q9BTX3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM208Q9BTX3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM208Q9BTX3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM208Q9BTX3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM208Q9BTX3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM208Q9BTX3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM208Q9BTX3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM208Q9BTX3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM208Q9BTX3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM208Q9BTX3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM208Q9BTX3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM208Q9BTX3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM208Q9BTX3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM208Q9BTX3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM208Q9BTX3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM208Q9BTX3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM208Q9BTX3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM208Q9BTX3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM208Q9BTX3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM208Q9BTX3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM208Q9BTX3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM208Q9BTX3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM208Q9BTX3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM208Q9BTX3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM208Q9BTX3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM208Q9BTX3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM208Q9BTX3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM208Q9BTX3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM208Q9BTX3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM208Q9BTX3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM208Q9BTX3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM208Q9BTX3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM208Q9BTX3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM208Q9BTX3 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM208Q9BTX3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM208Q9BTX3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM208Q9BTX3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM208Q9BTX3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM208Q9BTX3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM208Q9BTX3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM208Q9BTX3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM208Q9BTX3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM208Q9BTX3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM208Q9BTX3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM208Q9BTX3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM208Q9BTX3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM208Q9BTX3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM208Q9BTX3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM208Q9BTX3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM208Q9BTX3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM208Q9BTX3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM208Q9BTX3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM208Q9BTX3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM208Q9BTX3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM208Q9BTX3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM208Q9BTX3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM208Q9BTX3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM208Q9BTX3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM208Q9BTX3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM208Q9BTX3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM208Q9BTX3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM208Q9BTX3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM208Q9BTX3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM208Q9BTX3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM208Q9BTX3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM208Q9BTX3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM208Q9BTX3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM208Q9BTX3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM208Q9BTX3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM208Q9BTX3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM208Q9BTX3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM208Q9BTX3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM208Q9BTX3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM208Q9BTX3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM208Q9BTX3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM208Q9BTX3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM208Q9BTX3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM208Q9BTX3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM208Q9BTX3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM208Q9BTX3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM208Q9BTX3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM208Q9BTX3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM208Q9BTX3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM208Q9BTX3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM208Q9BTX3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM208Q9BTX3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM208Q9BTX3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM208Q9BTX3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM208Q9BTX3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM208Q9BTX3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms