Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
THUMPD2Q9BTF0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
THUMPD2Q9BTF0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
THUMPD2Q9BTF0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
THUMPD2Q9BTF0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
THUMPD2Q9BTF0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
THUMPD2Q9BTF0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
THUMPD2Q9BTF0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
THUMPD2Q9BTF0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
THUMPD2Q9BTF0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
THUMPD2Q9BTF0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
THUMPD2Q9BTF0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
THUMPD2Q9BTF0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
THUMPD2Q9BTF0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
THUMPD2Q9BTF0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
THUMPD2Q9BTF0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
THUMPD2Q9BTF0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
THUMPD2Q9BTF0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
THUMPD2Q9BTF0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
THUMPD2Q9BTF0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
THUMPD2Q9BTF0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
THUMPD2Q9BTF0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
THUMPD2Q9BTF0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
THUMPD2Q9BTF0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
THUMPD2Q9BTF0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
THUMPD2Q9BTF0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
THUMPD2Q9BTF0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
THUMPD2Q9BTF0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
THUMPD2Q9BTF0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
THUMPD2Q9BTF0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
THUMPD2Q9BTF0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
THUMPD2Q9BTF0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
THUMPD2Q9BTF0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
THUMPD2Q9BTF0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
THUMPD2Q9BTF0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
THUMPD2Q9BTF0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
THUMPD2Q9BTF0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
THUMPD2Q9BTF0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
THUMPD2Q9BTF0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
THUMPD2Q9BTF0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
THUMPD2Q9BTF0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
THUMPD2Q9BTF0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
THUMPD2Q9BTF0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
THUMPD2Q9BTF0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
THUMPD2Q9BTF0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
THUMPD2Q9BTF0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
THUMPD2Q9BTF0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
THUMPD2Q9BTF0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
THUMPD2Q9BTF0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
THUMPD2Q9BTF0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
THUMPD2Q9BTF0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
THUMPD2Q9BTF0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
THUMPD2Q9BTF0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
THUMPD2Q9BTF0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
THUMPD2Q9BTF0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
THUMPD2Q9BTF0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
THUMPD2Q9BTF0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
THUMPD2Q9BTF0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
THUMPD2Q9BTF0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
THUMPD2Q9BTF0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
THUMPD2Q9BTF0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
THUMPD2Q9BTF0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
THUMPD2Q9BTF0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
THUMPD2Q9BTF0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
THUMPD2Q9BTF0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
THUMPD2Q9BTF0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
THUMPD2Q9BTF0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
THUMPD2Q9BTF0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
THUMPD2Q9BTF0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
THUMPD2Q9BTF0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
THUMPD2Q9BTF0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
THUMPD2Q9BTF0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
THUMPD2Q9BTF0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
THUMPD2Q9BTF0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
THUMPD2Q9BTF0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
THUMPD2Q9BTF0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
THUMPD2Q9BTF0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
THUMPD2Q9BTF0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.89■■■□□ 2.38
THUMPD2Q9BTF0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
THUMPD2Q9BTF0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
THUMPD2Q9BTF0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
THUMPD2Q9BTF0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
THUMPD2Q9BTF0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
THUMPD2Q9BTF0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
THUMPD2Q9BTF0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
THUMPD2Q9BTF0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
THUMPD2Q9BTF0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
THUMPD2Q9BTF0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
THUMPD2Q9BTF0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
THUMPD2Q9BTF0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC29.87■■■□□ 2.37
THUMPD2Q9BTF0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
THUMPD2Q9BTF0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
THUMPD2Q9BTF0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
THUMPD2Q9BTF0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
THUMPD2Q9BTF0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
THUMPD2Q9BTF0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
THUMPD2Q9BTF0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
THUMPD2Q9BTF0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
THUMPD2Q9BTF0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
THUMPD2Q9BTF0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms