Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT78

COPS4, COP9 signalosome complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4Q9BT78 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COPS4Q9BT78 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COPS4Q9BT78 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COPS4Q9BT78 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
COPS4Q9BT78 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
COPS4Q9BT78 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
COPS4Q9BT78 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
COPS4Q9BT78 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
COPS4Q9BT78 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
COPS4Q9BT78 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
COPS4Q9BT78 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
COPS4Q9BT78 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
COPS4Q9BT78 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
COPS4Q9BT78 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
COPS4Q9BT78 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
COPS4Q9BT78 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
COPS4Q9BT78 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
COPS4Q9BT78 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
COPS4Q9BT78 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COPS4Q9BT78 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COPS4Q9BT78 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COPS4Q9BT78 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COPS4Q9BT78 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COPS4Q9BT78 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COPS4Q9BT78 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COPS4Q9BT78 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COPS4Q9BT78 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COPS4Q9BT78 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COPS4Q9BT78 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COPS4Q9BT78 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COPS4Q9BT78 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COPS4Q9BT78 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COPS4Q9BT78 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COPS4Q9BT78 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COPS4Q9BT78 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COPS4Q9BT78 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COPS4Q9BT78 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COPS4Q9BT78 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COPS4Q9BT78 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COPS4Q9BT78 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COPS4Q9BT78 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COPS4Q9BT78 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COPS4Q9BT78 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
COPS4Q9BT78 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COPS4Q9BT78 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COPS4Q9BT78 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COPS4Q9BT78 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
COPS4Q9BT78 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COPS4Q9BT78 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
COPS4Q9BT78 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
COPS4Q9BT78 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
COPS4Q9BT78 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COPS4Q9BT78 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COPS4Q9BT78 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COPS4Q9BT78 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
COPS4Q9BT78 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COPS4Q9BT78 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COPS4Q9BT78 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COPS4Q9BT78 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COPS4Q9BT78 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COPS4Q9BT78 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COPS4Q9BT78 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COPS4Q9BT78 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COPS4Q9BT78 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COPS4Q9BT78 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COPS4Q9BT78 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COPS4Q9BT78 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
COPS4Q9BT78 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COPS4Q9BT78 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COPS4Q9BT78 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
COPS4Q9BT78 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COPS4Q9BT78 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
COPS4Q9BT78 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
COPS4Q9BT78 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
COPS4Q9BT78 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
COPS4Q9BT78 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
COPS4Q9BT78 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
COPS4Q9BT78 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
COPS4Q9BT78 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
COPS4Q9BT78 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
COPS4Q9BT78 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
COPS4Q9BT78 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
COPS4Q9BT78 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
COPS4Q9BT78 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
COPS4Q9BT78 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
COPS4Q9BT78 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
COPS4Q9BT78 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COPS4Q9BT78 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COPS4Q9BT78 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COPS4Q9BT78 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COPS4Q9BT78 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COPS4Q9BT78 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COPS4Q9BT78 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COPS4Q9BT78 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COPS4Q9BT78 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
COPS4Q9BT78 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COPS4Q9BT78 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COPS4Q9BT78 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COPS4Q9BT78 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COPS4Q9BT78 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms