Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSJ2

TUBGCP2, Gamma-tubulin complex component 2, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP2Q9BSJ2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBGCP2Q9BSJ2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBGCP2Q9BSJ2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBGCP2Q9BSJ2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBGCP2Q9BSJ2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBGCP2Q9BSJ2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBGCP2Q9BSJ2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBGCP2Q9BSJ2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBGCP2Q9BSJ2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBGCP2Q9BSJ2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBGCP2Q9BSJ2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBGCP2Q9BSJ2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBGCP2Q9BSJ2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBGCP2Q9BSJ2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBGCP2Q9BSJ2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBGCP2Q9BSJ2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBGCP2Q9BSJ2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBGCP2Q9BSJ2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBGCP2Q9BSJ2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBGCP2Q9BSJ2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBGCP2Q9BSJ2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBGCP2Q9BSJ2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBGCP2Q9BSJ2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBGCP2Q9BSJ2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBGCP2Q9BSJ2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBGCP2Q9BSJ2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBGCP2Q9BSJ2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBGCP2Q9BSJ2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBGCP2Q9BSJ2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBGCP2Q9BSJ2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBGCP2Q9BSJ2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBGCP2Q9BSJ2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBGCP2Q9BSJ2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBGCP2Q9BSJ2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBGCP2Q9BSJ2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBGCP2Q9BSJ2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBGCP2Q9BSJ2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBGCP2Q9BSJ2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBGCP2Q9BSJ2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBGCP2Q9BSJ2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBGCP2Q9BSJ2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBGCP2Q9BSJ2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBGCP2Q9BSJ2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBGCP2Q9BSJ2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBGCP2Q9BSJ2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TUBGCP2Q9BSJ2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TUBGCP2Q9BSJ2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TUBGCP2Q9BSJ2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TUBGCP2Q9BSJ2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TUBGCP2Q9BSJ2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TUBGCP2Q9BSJ2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TUBGCP2Q9BSJ2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TUBGCP2Q9BSJ2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TUBGCP2Q9BSJ2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TUBGCP2Q9BSJ2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TUBGCP2Q9BSJ2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TUBGCP2Q9BSJ2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TUBGCP2Q9BSJ2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TUBGCP2Q9BSJ2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TUBGCP2Q9BSJ2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TUBGCP2Q9BSJ2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBGCP2Q9BSJ2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBGCP2Q9BSJ2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBGCP2Q9BSJ2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBGCP2Q9BSJ2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBGCP2Q9BSJ2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBGCP2Q9BSJ2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBGCP2Q9BSJ2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBGCP2Q9BSJ2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBGCP2Q9BSJ2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBGCP2Q9BSJ2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBGCP2Q9BSJ2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBGCP2Q9BSJ2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBGCP2Q9BSJ2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBGCP2Q9BSJ2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBGCP2Q9BSJ2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TUBGCP2Q9BSJ2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TUBGCP2Q9BSJ2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TUBGCP2Q9BSJ2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TUBGCP2Q9BSJ2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TUBGCP2Q9BSJ2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TUBGCP2Q9BSJ2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TUBGCP2Q9BSJ2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TUBGCP2Q9BSJ2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBGCP2Q9BSJ2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBGCP2Q9BSJ2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBGCP2Q9BSJ2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBGCP2Q9BSJ2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBGCP2Q9BSJ2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBGCP2Q9BSJ2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBGCP2Q9BSJ2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBGCP2Q9BSJ2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBGCP2Q9BSJ2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBGCP2Q9BSJ2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TUBGCP2Q9BSJ2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TUBGCP2Q9BSJ2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TUBGCP2Q9BSJ2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TUBGCP2Q9BSJ2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TUBGCP2Q9BSJ2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TUBGCP2Q9BSJ2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms