Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEC22CQ9BRL7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEC22CQ9BRL7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEC22CQ9BRL7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEC22CQ9BRL7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEC22CQ9BRL7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEC22CQ9BRL7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEC22CQ9BRL7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEC22CQ9BRL7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEC22CQ9BRL7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEC22CQ9BRL7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEC22CQ9BRL7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEC22CQ9BRL7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEC22CQ9BRL7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEC22CQ9BRL7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEC22CQ9BRL7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEC22CQ9BRL7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEC22CQ9BRL7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEC22CQ9BRL7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEC22CQ9BRL7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEC22CQ9BRL7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEC22CQ9BRL7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEC22CQ9BRL7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEC22CQ9BRL7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEC22CQ9BRL7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEC22CQ9BRL7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEC22CQ9BRL7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEC22CQ9BRL7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEC22CQ9BRL7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEC22CQ9BRL7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SEC22CQ9BRL7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEC22CQ9BRL7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEC22CQ9BRL7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEC22CQ9BRL7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEC22CQ9BRL7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEC22CQ9BRL7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEC22CQ9BRL7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEC22CQ9BRL7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEC22CQ9BRL7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEC22CQ9BRL7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEC22CQ9BRL7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEC22CQ9BRL7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEC22CQ9BRL7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEC22CQ9BRL7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEC22CQ9BRL7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEC22CQ9BRL7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEC22CQ9BRL7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEC22CQ9BRL7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEC22CQ9BRL7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEC22CQ9BRL7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEC22CQ9BRL7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEC22CQ9BRL7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SEC22CQ9BRL7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SEC22CQ9BRL7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SEC22CQ9BRL7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEC22CQ9BRL7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEC22CQ9BRL7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEC22CQ9BRL7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEC22CQ9BRL7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEC22CQ9BRL7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEC22CQ9BRL7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEC22CQ9BRL7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEC22CQ9BRL7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEC22CQ9BRL7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEC22CQ9BRL7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEC22CQ9BRL7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEC22CQ9BRL7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEC22CQ9BRL7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEC22CQ9BRL7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEC22CQ9BRL7 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEC22CQ9BRL7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEC22CQ9BRL7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEC22CQ9BRL7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEC22CQ9BRL7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEC22CQ9BRL7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEC22CQ9BRL7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEC22CQ9BRL7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEC22CQ9BRL7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEC22CQ9BRL7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEC22CQ9BRL7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEC22CQ9BRL7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SEC22CQ9BRL7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SEC22CQ9BRL7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SEC22CQ9BRL7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SEC22CQ9BRL7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SEC22CQ9BRL7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SEC22CQ9BRL7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SEC22CQ9BRL7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SEC22CQ9BRL7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SEC22CQ9BRL7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SEC22CQ9BRL7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SEC22CQ9BRL7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SEC22CQ9BRL7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SEC22CQ9BRL7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SEC22CQ9BRL7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SEC22CQ9BRL7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SEC22CQ9BRL7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SEC22CQ9BRL7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SEC22CQ9BRL7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEC22CQ9BRL7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms