Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM7Q9BQ49 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM7Q9BQ49 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM7Q9BQ49 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM7Q9BQ49 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM7Q9BQ49 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM7Q9BQ49 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM7Q9BQ49 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM7Q9BQ49 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM7Q9BQ49 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM7Q9BQ49 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM7Q9BQ49 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMIM7Q9BQ49 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMIM7Q9BQ49 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMIM7Q9BQ49 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMIM7Q9BQ49 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMIM7Q9BQ49 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMIM7Q9BQ49 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMIM7Q9BQ49 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMIM7Q9BQ49 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMIM7Q9BQ49 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SMIM7Q9BQ49 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMIM7Q9BQ49 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMIM7Q9BQ49 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMIM7Q9BQ49 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMIM7Q9BQ49 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMIM7Q9BQ49 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM7Q9BQ49 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM7Q9BQ49 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM7Q9BQ49 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM7Q9BQ49 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM7Q9BQ49 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM7Q9BQ49 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM7Q9BQ49 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM7Q9BQ49 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM7Q9BQ49 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM7Q9BQ49 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM7Q9BQ49 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM7Q9BQ49 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM7Q9BQ49 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM7Q9BQ49 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM7Q9BQ49 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM7Q9BQ49 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM7Q9BQ49 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM7Q9BQ49 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM7Q9BQ49 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM7Q9BQ49 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM7Q9BQ49 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM7Q9BQ49 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM7Q9BQ49 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM7Q9BQ49 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM7Q9BQ49 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMIM7Q9BQ49 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMIM7Q9BQ49 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMIM7Q9BQ49 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMIM7Q9BQ49 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMIM7Q9BQ49 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMIM7Q9BQ49 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMIM7Q9BQ49 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMIM7Q9BQ49 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMIM7Q9BQ49 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMIM7Q9BQ49 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMIM7Q9BQ49 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMIM7Q9BQ49 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMIM7Q9BQ49 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMIM7Q9BQ49 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMIM7Q9BQ49 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMIM7Q9BQ49 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMIM7Q9BQ49 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMIM7Q9BQ49 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMIM7Q9BQ49 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMIM7Q9BQ49 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMIM7Q9BQ49 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMIM7Q9BQ49 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMIM7Q9BQ49 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMIM7Q9BQ49 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMIM7Q9BQ49 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMIM7Q9BQ49 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMIM7Q9BQ49 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMIM7Q9BQ49 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMIM7Q9BQ49 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMIM7Q9BQ49 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMIM7Q9BQ49 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMIM7Q9BQ49 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMIM7Q9BQ49 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMIM7Q9BQ49 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMIM7Q9BQ49 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMIM7Q9BQ49 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMIM7Q9BQ49 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMIM7Q9BQ49 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMIM7Q9BQ49 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMIM7Q9BQ49 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMIM7Q9BQ49 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMIM7Q9BQ49 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMIM7Q9BQ49 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMIM7Q9BQ49 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMIM7Q9BQ49 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMIM7Q9BQ49 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMIM7Q9BQ49 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMIM7Q9BQ49 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms