Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPX3

NCAPG, Condensin complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPGQ9BPX3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NCAPGQ9BPX3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NCAPGQ9BPX3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NCAPGQ9BPX3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCAPGQ9BPX3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCAPGQ9BPX3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCAPGQ9BPX3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCAPGQ9BPX3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCAPGQ9BPX3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCAPGQ9BPX3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCAPGQ9BPX3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCAPGQ9BPX3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCAPGQ9BPX3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCAPGQ9BPX3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCAPGQ9BPX3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NCAPGQ9BPX3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCAPGQ9BPX3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCAPGQ9BPX3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCAPGQ9BPX3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCAPGQ9BPX3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCAPGQ9BPX3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCAPGQ9BPX3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCAPGQ9BPX3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCAPGQ9BPX3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NCAPGQ9BPX3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCAPGQ9BPX3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCAPGQ9BPX3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCAPGQ9BPX3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCAPGQ9BPX3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NCAPGQ9BPX3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCAPGQ9BPX3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCAPGQ9BPX3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCAPGQ9BPX3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCAPGQ9BPX3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCAPGQ9BPX3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCAPGQ9BPX3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCAPGQ9BPX3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCAPGQ9BPX3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCAPGQ9BPX3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCAPGQ9BPX3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCAPGQ9BPX3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCAPGQ9BPX3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCAPGQ9BPX3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCAPGQ9BPX3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCAPGQ9BPX3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCAPGQ9BPX3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCAPGQ9BPX3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCAPGQ9BPX3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCAPGQ9BPX3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCAPGQ9BPX3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NCAPGQ9BPX3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCAPGQ9BPX3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCAPGQ9BPX3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCAPGQ9BPX3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCAPGQ9BPX3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NCAPGQ9BPX3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCAPGQ9BPX3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCAPGQ9BPX3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCAPGQ9BPX3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCAPGQ9BPX3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NCAPGQ9BPX3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NCAPGQ9BPX3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCAPGQ9BPX3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCAPGQ9BPX3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCAPGQ9BPX3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCAPGQ9BPX3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCAPGQ9BPX3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCAPGQ9BPX3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NCAPGQ9BPX3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCAPGQ9BPX3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCAPGQ9BPX3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCAPGQ9BPX3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCAPGQ9BPX3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCAPGQ9BPX3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCAPGQ9BPX3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCAPGQ9BPX3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCAPGQ9BPX3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCAPGQ9BPX3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCAPGQ9BPX3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCAPGQ9BPX3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCAPGQ9BPX3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NCAPGQ9BPX3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCAPGQ9BPX3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCAPGQ9BPX3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCAPGQ9BPX3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCAPGQ9BPX3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCAPGQ9BPX3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCAPGQ9BPX3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCAPGQ9BPX3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCAPGQ9BPX3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCAPGQ9BPX3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCAPGQ9BPX3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCAPGQ9BPX3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCAPGQ9BPX3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCAPGQ9BPX3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCAPGQ9BPX3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCAPGQ9BPX3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCAPGQ9BPX3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCAPGQ9BPX3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCAPGQ9BPX3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms