Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VAT1Q99536 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VAT1Q99536 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VAT1Q99536 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VAT1Q99536 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VAT1Q99536 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VAT1Q99536 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VAT1Q99536 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VAT1Q99536 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VAT1Q99536 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VAT1Q99536 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VAT1Q99536 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VAT1Q99536 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VAT1Q99536 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VAT1Q99536 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VAT1Q99536 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VAT1Q99536 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VAT1Q99536 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VAT1Q99536 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VAT1Q99536 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VAT1Q99536 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VAT1Q99536 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VAT1Q99536 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VAT1Q99536 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VAT1Q99536 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VAT1Q99536 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VAT1Q99536 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VAT1Q99536 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VAT1Q99536 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VAT1Q99536 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VAT1Q99536 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VAT1Q99536 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VAT1Q99536 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VAT1Q99536 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VAT1Q99536 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VAT1Q99536 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VAT1Q99536 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VAT1Q99536 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VAT1Q99536 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VAT1Q99536 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VAT1Q99536 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VAT1Q99536 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VAT1Q99536 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VAT1Q99536 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VAT1Q99536 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VAT1Q99536 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VAT1Q99536 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VAT1Q99536 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VAT1Q99536 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VAT1Q99536 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VAT1Q99536 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VAT1Q99536 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VAT1Q99536 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VAT1Q99536 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VAT1Q99536 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VAT1Q99536 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VAT1Q99536 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VAT1Q99536 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VAT1Q99536 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VAT1Q99536 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VAT1Q99536 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VAT1Q99536 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VAT1Q99536 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VAT1Q99536 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VAT1Q99536 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VAT1Q99536 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VAT1Q99536 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VAT1Q99536 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VAT1Q99536 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VAT1Q99536 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VAT1Q99536 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VAT1Q99536 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VAT1Q99536 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VAT1Q99536 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VAT1Q99536 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
VAT1Q99536 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VAT1Q99536 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VAT1Q99536 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
VAT1Q99536 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VAT1Q99536 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
VAT1Q99536 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VAT1Q99536 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VAT1Q99536 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VAT1Q99536 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VAT1Q99536 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VAT1Q99536 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VAT1Q99536 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VAT1Q99536 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VAT1Q99536 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VAT1Q99536 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VAT1Q99536 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VAT1Q99536 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VAT1Q99536 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
VAT1Q99536 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VAT1Q99536 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VAT1Q99536 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VAT1Q99536 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VAT1Q99536 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VAT1Q99536 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VAT1Q99536 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms