Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK4

BBS4, Bardet-Biedl syndrome 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS4Q96RK4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BBS4Q96RK4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BBS4Q96RK4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BBS4Q96RK4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BBS4Q96RK4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BBS4Q96RK4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BBS4Q96RK4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
BBS4Q96RK4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BBS4Q96RK4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BBS4Q96RK4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BBS4Q96RK4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BBS4Q96RK4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BBS4Q96RK4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BBS4Q96RK4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
BBS4Q96RK4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BBS4Q96RK4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BBS4Q96RK4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BBS4Q96RK4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BBS4Q96RK4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BBS4Q96RK4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BBS4Q96RK4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BBS4Q96RK4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BBS4Q96RK4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BBS4Q96RK4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BBS4Q96RK4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BBS4Q96RK4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BBS4Q96RK4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BBS4Q96RK4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BBS4Q96RK4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
BBS4Q96RK4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BBS4Q96RK4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BBS4Q96RK4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BBS4Q96RK4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BBS4Q96RK4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
BBS4Q96RK4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BBS4Q96RK4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BBS4Q96RK4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BBS4Q96RK4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BBS4Q96RK4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BBS4Q96RK4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BBS4Q96RK4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BBS4Q96RK4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BBS4Q96RK4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BBS4Q96RK4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BBS4Q96RK4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BBS4Q96RK4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BBS4Q96RK4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BBS4Q96RK4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BBS4Q96RK4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BBS4Q96RK4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BBS4Q96RK4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BBS4Q96RK4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BBS4Q96RK4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BBS4Q96RK4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BBS4Q96RK4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BBS4Q96RK4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BBS4Q96RK4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BBS4Q96RK4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BBS4Q96RK4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BBS4Q96RK4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BBS4Q96RK4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BBS4Q96RK4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BBS4Q96RK4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BBS4Q96RK4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BBS4Q96RK4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BBS4Q96RK4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BBS4Q96RK4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BBS4Q96RK4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BBS4Q96RK4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BBS4Q96RK4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BBS4Q96RK4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BBS4Q96RK4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BBS4Q96RK4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BBS4Q96RK4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BBS4Q96RK4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BBS4Q96RK4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BBS4Q96RK4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BBS4Q96RK4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BBS4Q96RK4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BBS4Q96RK4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BBS4Q96RK4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BBS4Q96RK4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BBS4Q96RK4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BBS4Q96RK4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BBS4Q96RK4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BBS4Q96RK4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BBS4Q96RK4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BBS4Q96RK4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BBS4Q96RK4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BBS4Q96RK4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BBS4Q96RK4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BBS4Q96RK4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BBS4Q96RK4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BBS4Q96RK4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BBS4Q96RK4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BBS4Q96RK4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BBS4Q96RK4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BBS4Q96RK4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BBS4Q96RK4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
BBS4Q96RK4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms