Protein–RNA interactions for Protein: Q96QP1

ALPK1, Alpha-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK1Q96QP1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALPK1Q96QP1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALPK1Q96QP1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALPK1Q96QP1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALPK1Q96QP1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALPK1Q96QP1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ALPK1Q96QP1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALPK1Q96QP1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ALPK1Q96QP1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALPK1Q96QP1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALPK1Q96QP1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALPK1Q96QP1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALPK1Q96QP1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALPK1Q96QP1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALPK1Q96QP1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALPK1Q96QP1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALPK1Q96QP1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALPK1Q96QP1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALPK1Q96QP1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALPK1Q96QP1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALPK1Q96QP1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALPK1Q96QP1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALPK1Q96QP1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALPK1Q96QP1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALPK1Q96QP1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALPK1Q96QP1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALPK1Q96QP1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALPK1Q96QP1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALPK1Q96QP1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALPK1Q96QP1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALPK1Q96QP1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ALPK1Q96QP1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALPK1Q96QP1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ALPK1Q96QP1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ALPK1Q96QP1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ALPK1Q96QP1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ALPK1Q96QP1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ALPK1Q96QP1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALPK1Q96QP1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALPK1Q96QP1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ALPK1Q96QP1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALPK1Q96QP1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ALPK1Q96QP1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALPK1Q96QP1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALPK1Q96QP1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ALPK1Q96QP1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ALPK1Q96QP1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
ALPK1Q96QP1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALPK1Q96QP1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ALPK1Q96QP1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALPK1Q96QP1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ALPK1Q96QP1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ALPK1Q96QP1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ALPK1Q96QP1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALPK1Q96QP1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ALPK1Q96QP1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ALPK1Q96QP1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ALPK1Q96QP1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALPK1Q96QP1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ALPK1Q96QP1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALPK1Q96QP1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ALPK1Q96QP1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ALPK1Q96QP1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ALPK1Q96QP1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ALPK1Q96QP1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALPK1Q96QP1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALPK1Q96QP1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ALPK1Q96QP1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ALPK1Q96QP1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALPK1Q96QP1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ALPK1Q96QP1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALPK1Q96QP1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALPK1Q96QP1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ALPK1Q96QP1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ALPK1Q96QP1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ALPK1Q96QP1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ALPK1Q96QP1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALPK1Q96QP1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALPK1Q96QP1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALPK1Q96QP1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ALPK1Q96QP1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ALPK1Q96QP1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALPK1Q96QP1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALPK1Q96QP1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ALPK1Q96QP1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ALPK1Q96QP1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ALPK1Q96QP1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALPK1Q96QP1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ALPK1Q96QP1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALPK1Q96QP1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALPK1Q96QP1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALPK1Q96QP1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ALPK1Q96QP1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ALPK1Q96QP1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ALPK1Q96QP1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ALPK1Q96QP1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ALPK1Q96QP1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ALPK1Q96QP1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ALPK1Q96QP1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ALPK1Q96QP1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.6 ms