Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC38A2Q96QD8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC38A2Q96QD8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC38A2Q96QD8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC38A2Q96QD8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC38A2Q96QD8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC38A2Q96QD8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC38A2Q96QD8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC38A2Q96QD8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC38A2Q96QD8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC38A2Q96QD8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC38A2Q96QD8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC38A2Q96QD8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC38A2Q96QD8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC38A2Q96QD8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC38A2Q96QD8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC38A2Q96QD8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC38A2Q96QD8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC38A2Q96QD8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC38A2Q96QD8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC38A2Q96QD8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC38A2Q96QD8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC38A2Q96QD8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC38A2Q96QD8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC38A2Q96QD8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC38A2Q96QD8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC38A2Q96QD8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC38A2Q96QD8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC38A2Q96QD8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC38A2Q96QD8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC38A2Q96QD8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC38A2Q96QD8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC38A2Q96QD8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC38A2Q96QD8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC38A2Q96QD8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC38A2Q96QD8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC38A2Q96QD8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC38A2Q96QD8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC38A2Q96QD8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC38A2Q96QD8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC38A2Q96QD8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC38A2Q96QD8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC38A2Q96QD8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC38A2Q96QD8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SLC38A2Q96QD8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC38A2Q96QD8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC38A2Q96QD8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC38A2Q96QD8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC38A2Q96QD8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC38A2Q96QD8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC38A2Q96QD8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC38A2Q96QD8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC38A2Q96QD8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC38A2Q96QD8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC38A2Q96QD8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC38A2Q96QD8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC38A2Q96QD8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC38A2Q96QD8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC38A2Q96QD8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC38A2Q96QD8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC38A2Q96QD8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC38A2Q96QD8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC38A2Q96QD8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC38A2Q96QD8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC38A2Q96QD8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC38A2Q96QD8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC38A2Q96QD8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC38A2Q96QD8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC38A2Q96QD8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC38A2Q96QD8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC38A2Q96QD8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC38A2Q96QD8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC38A2Q96QD8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC38A2Q96QD8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC38A2Q96QD8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC38A2Q96QD8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC38A2Q96QD8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC38A2Q96QD8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC38A2Q96QD8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC38A2Q96QD8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC38A2Q96QD8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC38A2Q96QD8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC38A2Q96QD8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC38A2Q96QD8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC38A2Q96QD8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC38A2Q96QD8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC38A2Q96QD8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC38A2Q96QD8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC38A2Q96QD8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC38A2Q96QD8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC38A2Q96QD8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC38A2Q96QD8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC38A2Q96QD8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC38A2Q96QD8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC38A2Q96QD8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC38A2Q96QD8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC38A2Q96QD8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC38A2Q96QD8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC38A2Q96QD8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC38A2Q96QD8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms