Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
LMTK3Q96Q04 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
LMTK3Q96Q04 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
LMTK3Q96Q04 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC33.69■■■□□ 2.98
LMTK3Q96Q04 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
LMTK3Q96Q04 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
LMTK3Q96Q04 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
LMTK3Q96Q04 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
LMTK3Q96Q04 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
LMTK3Q96Q04 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
LMTK3Q96Q04 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
LMTK3Q96Q04 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
LMTK3Q96Q04 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
LMTK3Q96Q04 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
LMTK3Q96Q04 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
LMTK3Q96Q04 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
LMTK3Q96Q04 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
LMTK3Q96Q04 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
LMTK3Q96Q04 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC33.66■■■□□ 2.98
LMTK3Q96Q04 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
LMTK3Q96Q04 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
LMTK3Q96Q04 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
LMTK3Q96Q04 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
LMTK3Q96Q04 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
LMTK3Q96Q04 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
LMTK3Q96Q04 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
LMTK3Q96Q04 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
LMTK3Q96Q04 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
LMTK3Q96Q04 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
LMTK3Q96Q04 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC33.64■■■□□ 2.98
LMTK3Q96Q04 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
LMTK3Q96Q04 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
LMTK3Q96Q04 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
LMTK3Q96Q04 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
LMTK3Q96Q04 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC33.63■■■□□ 2.97
LMTK3Q96Q04 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
LMTK3Q96Q04 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
LMTK3Q96Q04 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
LMTK3Q96Q04 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
LMTK3Q96Q04 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
LMTK3Q96Q04 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
LMTK3Q96Q04 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
LMTK3Q96Q04 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
LMTK3Q96Q04 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
LMTK3Q96Q04 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
LMTK3Q96Q04 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
LMTK3Q96Q04 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
LMTK3Q96Q04 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC33.62■■■□□ 2.97
LMTK3Q96Q04 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
LMTK3Q96Q04 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
LMTK3Q96Q04 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
LMTK3Q96Q04 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
LMTK3Q96Q04 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
LMTK3Q96Q04 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
LMTK3Q96Q04 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
LMTK3Q96Q04 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
LMTK3Q96Q04 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
LMTK3Q96Q04 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
LMTK3Q96Q04 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
LMTK3Q96Q04 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
LMTK3Q96Q04 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
LMTK3Q96Q04 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
LMTK3Q96Q04 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
LMTK3Q96Q04 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
LMTK3Q96Q04 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
LMTK3Q96Q04 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC33.59■■■□□ 2.97
LMTK3Q96Q04 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
LMTK3Q96Q04 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
LMTK3Q96Q04 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
LMTK3Q96Q04 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
LMTK3Q96Q04 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
LMTK3Q96Q04 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
LMTK3Q96Q04 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
LMTK3Q96Q04 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
LMTK3Q96Q04 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
LMTK3Q96Q04 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
LMTK3Q96Q04 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
LMTK3Q96Q04 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
LMTK3Q96Q04 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.97
LMTK3Q96Q04 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
LMTK3Q96Q04 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
LMTK3Q96Q04 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
LMTK3Q96Q04 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
LMTK3Q96Q04 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
LMTK3Q96Q04 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
LMTK3Q96Q04 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
LMTK3Q96Q04 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
LMTK3Q96Q04 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
LMTK3Q96Q04 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
LMTK3Q96Q04 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
LMTK3Q96Q04 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
LMTK3Q96Q04 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
LMTK3Q96Q04 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
LMTK3Q96Q04 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
LMTK3Q96Q04 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
LMTK3Q96Q04 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
LMTK3Q96Q04 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
LMTK3Q96Q04 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC33.54■■■□□ 2.96
LMTK3Q96Q04 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
LMTK3Q96Q04 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms