Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSNARE1Q96NA8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TSNARE1Q96NA8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSNARE1Q96NA8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSNARE1Q96NA8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSNARE1Q96NA8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSNARE1Q96NA8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSNARE1Q96NA8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSNARE1Q96NA8 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSNARE1Q96NA8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSNARE1Q96NA8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSNARE1Q96NA8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TSNARE1Q96NA8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSNARE1Q96NA8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSNARE1Q96NA8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSNARE1Q96NA8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSNARE1Q96NA8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSNARE1Q96NA8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSNARE1Q96NA8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSNARE1Q96NA8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSNARE1Q96NA8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSNARE1Q96NA8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSNARE1Q96NA8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSNARE1Q96NA8 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSNARE1Q96NA8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSNARE1Q96NA8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSNARE1Q96NA8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSNARE1Q96NA8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSNARE1Q96NA8 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSNARE1Q96NA8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSNARE1Q96NA8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSNARE1Q96NA8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSNARE1Q96NA8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TSNARE1Q96NA8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSNARE1Q96NA8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSNARE1Q96NA8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSNARE1Q96NA8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSNARE1Q96NA8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSNARE1Q96NA8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSNARE1Q96NA8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSNARE1Q96NA8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSNARE1Q96NA8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSNARE1Q96NA8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSNARE1Q96NA8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSNARE1Q96NA8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSNARE1Q96NA8 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSNARE1Q96NA8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSNARE1Q96NA8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSNARE1Q96NA8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSNARE1Q96NA8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSNARE1Q96NA8 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSNARE1Q96NA8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSNARE1Q96NA8 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSNARE1Q96NA8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSNARE1Q96NA8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSNARE1Q96NA8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSNARE1Q96NA8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSNARE1Q96NA8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSNARE1Q96NA8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSNARE1Q96NA8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSNARE1Q96NA8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TSNARE1Q96NA8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSNARE1Q96NA8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSNARE1Q96NA8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSNARE1Q96NA8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSNARE1Q96NA8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSNARE1Q96NA8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSNARE1Q96NA8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSNARE1Q96NA8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSNARE1Q96NA8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSNARE1Q96NA8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TSNARE1Q96NA8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSNARE1Q96NA8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TSNARE1Q96NA8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TSNARE1Q96NA8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSNARE1Q96NA8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSNARE1Q96NA8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSNARE1Q96NA8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSNARE1Q96NA8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSNARE1Q96NA8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSNARE1Q96NA8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSNARE1Q96NA8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSNARE1Q96NA8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TSNARE1Q96NA8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSNARE1Q96NA8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSNARE1Q96NA8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSNARE1Q96NA8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSNARE1Q96NA8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TSNARE1Q96NA8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSNARE1Q96NA8 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSNARE1Q96NA8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSNARE1Q96NA8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSNARE1Q96NA8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSNARE1Q96NA8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSNARE1Q96NA8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TSNARE1Q96NA8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSNARE1Q96NA8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSNARE1Q96NA8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSNARE1Q96NA8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TSNARE1Q96NA8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms