Protein–RNA interactions for Protein: Q96LW1

ZNF354B, Zinc finger protein 354B, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF354BQ96LW1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF354BQ96LW1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF354BQ96LW1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF354BQ96LW1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF354BQ96LW1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF354BQ96LW1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF354BQ96LW1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF354BQ96LW1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF354BQ96LW1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF354BQ96LW1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF354BQ96LW1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF354BQ96LW1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF354BQ96LW1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF354BQ96LW1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF354BQ96LW1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF354BQ96LW1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF354BQ96LW1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF354BQ96LW1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF354BQ96LW1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF354BQ96LW1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF354BQ96LW1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF354BQ96LW1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF354BQ96LW1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF354BQ96LW1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF354BQ96LW1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF354BQ96LW1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF354BQ96LW1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF354BQ96LW1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF354BQ96LW1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF354BQ96LW1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF354BQ96LW1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF354BQ96LW1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF354BQ96LW1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF354BQ96LW1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF354BQ96LW1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF354BQ96LW1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF354BQ96LW1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF354BQ96LW1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF354BQ96LW1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF354BQ96LW1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF354BQ96LW1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF354BQ96LW1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF354BQ96LW1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF354BQ96LW1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF354BQ96LW1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF354BQ96LW1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF354BQ96LW1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF354BQ96LW1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZNF354BQ96LW1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF354BQ96LW1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF354BQ96LW1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF354BQ96LW1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF354BQ96LW1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF354BQ96LW1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF354BQ96LW1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF354BQ96LW1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF354BQ96LW1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF354BQ96LW1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF354BQ96LW1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF354BQ96LW1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF354BQ96LW1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF354BQ96LW1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF354BQ96LW1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF354BQ96LW1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF354BQ96LW1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF354BQ96LW1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF354BQ96LW1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF354BQ96LW1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF354BQ96LW1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF354BQ96LW1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF354BQ96LW1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF354BQ96LW1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF354BQ96LW1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF354BQ96LW1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF354BQ96LW1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF354BQ96LW1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF354BQ96LW1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF354BQ96LW1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF354BQ96LW1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF354BQ96LW1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF354BQ96LW1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF354BQ96LW1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF354BQ96LW1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF354BQ96LW1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF354BQ96LW1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF354BQ96LW1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF354BQ96LW1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF354BQ96LW1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF354BQ96LW1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF354BQ96LW1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF354BQ96LW1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF354BQ96LW1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF354BQ96LW1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF354BQ96LW1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF354BQ96LW1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF354BQ96LW1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF354BQ96LW1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF354BQ96LW1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF354BQ96LW1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF354BQ96LW1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms