Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C9orf72Q96LT7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C9orf72Q96LT7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C9orf72Q96LT7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C9orf72Q96LT7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C9orf72Q96LT7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C9orf72Q96LT7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C9orf72Q96LT7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C9orf72Q96LT7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C9orf72Q96LT7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C9orf72Q96LT7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C9orf72Q96LT7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C9orf72Q96LT7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C9orf72Q96LT7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C9orf72Q96LT7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C9orf72Q96LT7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C9orf72Q96LT7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C9orf72Q96LT7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C9orf72Q96LT7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C9orf72Q96LT7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C9orf72Q96LT7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C9orf72Q96LT7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C9orf72Q96LT7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C9orf72Q96LT7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
C9orf72Q96LT7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
C9orf72Q96LT7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
C9orf72Q96LT7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C9orf72Q96LT7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C9orf72Q96LT7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C9orf72Q96LT7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
C9orf72Q96LT7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C9orf72Q96LT7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C9orf72Q96LT7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C9orf72Q96LT7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C9orf72Q96LT7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C9orf72Q96LT7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
C9orf72Q96LT7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C9orf72Q96LT7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C9orf72Q96LT7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C9orf72Q96LT7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C9orf72Q96LT7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C9orf72Q96LT7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C9orf72Q96LT7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C9orf72Q96LT7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C9orf72Q96LT7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C9orf72Q96LT7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C9orf72Q96LT7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C9orf72Q96LT7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C9orf72Q96LT7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C9orf72Q96LT7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C9orf72Q96LT7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C9orf72Q96LT7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C9orf72Q96LT7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C9orf72Q96LT7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
C9orf72Q96LT7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C9orf72Q96LT7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C9orf72Q96LT7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C9orf72Q96LT7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C9orf72Q96LT7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C9orf72Q96LT7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C9orf72Q96LT7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C9orf72Q96LT7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C9orf72Q96LT7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C9orf72Q96LT7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C9orf72Q96LT7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C9orf72Q96LT7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C9orf72Q96LT7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C9orf72Q96LT7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C9orf72Q96LT7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C9orf72Q96LT7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C9orf72Q96LT7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C9orf72Q96LT7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C9orf72Q96LT7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C9orf72Q96LT7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C9orf72Q96LT7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C9orf72Q96LT7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C9orf72Q96LT7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C9orf72Q96LT7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C9orf72Q96LT7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C9orf72Q96LT7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C9orf72Q96LT7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C9orf72Q96LT7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C9orf72Q96LT7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C9orf72Q96LT7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C9orf72Q96LT7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C9orf72Q96LT7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C9orf72Q96LT7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C9orf72Q96LT7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C9orf72Q96LT7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C9orf72Q96LT7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C9orf72Q96LT7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C9orf72Q96LT7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C9orf72Q96LT7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C9orf72Q96LT7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C9orf72Q96LT7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C9orf72Q96LT7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C9orf72Q96LT7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C9orf72Q96LT7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
C9orf72Q96LT7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C9orf72Q96LT7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms