Protein–RNA interactions for Protein: Q96LB3

IFT74, Intraflagellar transport protein 74 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT74Q96LB3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT74Q96LB3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFT74Q96LB3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFT74Q96LB3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFT74Q96LB3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFT74Q96LB3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT74Q96LB3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT74Q96LB3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT74Q96LB3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT74Q96LB3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT74Q96LB3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT74Q96LB3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT74Q96LB3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT74Q96LB3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT74Q96LB3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFT74Q96LB3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFT74Q96LB3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFT74Q96LB3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFT74Q96LB3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFT74Q96LB3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFT74Q96LB3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFT74Q96LB3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
IFT74Q96LB3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFT74Q96LB3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFT74Q96LB3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFT74Q96LB3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFT74Q96LB3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFT74Q96LB3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFT74Q96LB3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
IFT74Q96LB3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFT74Q96LB3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFT74Q96LB3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFT74Q96LB3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFT74Q96LB3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFT74Q96LB3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFT74Q96LB3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFT74Q96LB3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFT74Q96LB3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT74Q96LB3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT74Q96LB3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT74Q96LB3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT74Q96LB3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT74Q96LB3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT74Q96LB3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT74Q96LB3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT74Q96LB3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT74Q96LB3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT74Q96LB3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT74Q96LB3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFT74Q96LB3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFT74Q96LB3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFT74Q96LB3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFT74Q96LB3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
IFT74Q96LB3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFT74Q96LB3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFT74Q96LB3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT74Q96LB3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT74Q96LB3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT74Q96LB3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT74Q96LB3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT74Q96LB3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT74Q96LB3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT74Q96LB3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT74Q96LB3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT74Q96LB3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFT74Q96LB3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFT74Q96LB3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFT74Q96LB3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
IFT74Q96LB3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFT74Q96LB3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFT74Q96LB3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFT74Q96LB3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFT74Q96LB3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFT74Q96LB3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFT74Q96LB3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFT74Q96LB3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFT74Q96LB3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFT74Q96LB3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFT74Q96LB3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFT74Q96LB3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFT74Q96LB3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFT74Q96LB3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFT74Q96LB3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFT74Q96LB3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFT74Q96LB3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFT74Q96LB3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFT74Q96LB3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFT74Q96LB3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFT74Q96LB3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFT74Q96LB3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFT74Q96LB3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFT74Q96LB3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFT74Q96LB3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFT74Q96LB3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFT74Q96LB3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFT74Q96LB3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
IFT74Q96LB3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFT74Q96LB3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFT74Q96LB3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
IFT74Q96LB3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms