Protein–RNA interactions for Protein: Q96KP6

TNIP3, TNFAIP3-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP3Q96KP6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNIP3Q96KP6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNIP3Q96KP6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNIP3Q96KP6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNIP3Q96KP6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNIP3Q96KP6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNIP3Q96KP6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNIP3Q96KP6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNIP3Q96KP6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNIP3Q96KP6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNIP3Q96KP6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNIP3Q96KP6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNIP3Q96KP6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TNIP3Q96KP6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNIP3Q96KP6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNIP3Q96KP6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNIP3Q96KP6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNIP3Q96KP6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNIP3Q96KP6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNIP3Q96KP6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNIP3Q96KP6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNIP3Q96KP6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNIP3Q96KP6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TNIP3Q96KP6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TNIP3Q96KP6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNIP3Q96KP6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNIP3Q96KP6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNIP3Q96KP6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNIP3Q96KP6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNIP3Q96KP6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNIP3Q96KP6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNIP3Q96KP6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNIP3Q96KP6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNIP3Q96KP6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNIP3Q96KP6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNIP3Q96KP6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNIP3Q96KP6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TNIP3Q96KP6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNIP3Q96KP6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNIP3Q96KP6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TNIP3Q96KP6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNIP3Q96KP6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNIP3Q96KP6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNIP3Q96KP6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNIP3Q96KP6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNIP3Q96KP6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNIP3Q96KP6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNIP3Q96KP6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNIP3Q96KP6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNIP3Q96KP6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNIP3Q96KP6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNIP3Q96KP6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNIP3Q96KP6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNIP3Q96KP6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNIP3Q96KP6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNIP3Q96KP6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNIP3Q96KP6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNIP3Q96KP6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNIP3Q96KP6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNIP3Q96KP6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNIP3Q96KP6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNIP3Q96KP6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNIP3Q96KP6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNIP3Q96KP6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNIP3Q96KP6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNIP3Q96KP6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNIP3Q96KP6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNIP3Q96KP6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNIP3Q96KP6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNIP3Q96KP6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNIP3Q96KP6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNIP3Q96KP6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNIP3Q96KP6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNIP3Q96KP6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNIP3Q96KP6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNIP3Q96KP6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNIP3Q96KP6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNIP3Q96KP6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNIP3Q96KP6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNIP3Q96KP6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNIP3Q96KP6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNIP3Q96KP6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNIP3Q96KP6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNIP3Q96KP6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNIP3Q96KP6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNIP3Q96KP6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNIP3Q96KP6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNIP3Q96KP6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNIP3Q96KP6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNIP3Q96KP6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNIP3Q96KP6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNIP3Q96KP6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNIP3Q96KP6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNIP3Q96KP6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNIP3Q96KP6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNIP3Q96KP6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNIP3Q96KP6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNIP3Q96KP6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNIP3Q96KP6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNIP3Q96KP6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124 ms