Protein–RNA interactions for Protein: Q96JP9

CDHR1, Cadherin-related family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR1Q96JP9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDHR1Q96JP9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDHR1Q96JP9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDHR1Q96JP9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDHR1Q96JP9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDHR1Q96JP9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDHR1Q96JP9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDHR1Q96JP9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDHR1Q96JP9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDHR1Q96JP9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDHR1Q96JP9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDHR1Q96JP9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDHR1Q96JP9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDHR1Q96JP9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDHR1Q96JP9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDHR1Q96JP9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDHR1Q96JP9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDHR1Q96JP9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CDHR1Q96JP9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDHR1Q96JP9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDHR1Q96JP9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDHR1Q96JP9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDHR1Q96JP9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDHR1Q96JP9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDHR1Q96JP9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDHR1Q96JP9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDHR1Q96JP9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDHR1Q96JP9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDHR1Q96JP9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDHR1Q96JP9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDHR1Q96JP9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDHR1Q96JP9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDHR1Q96JP9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CDHR1Q96JP9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDHR1Q96JP9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDHR1Q96JP9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDHR1Q96JP9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDHR1Q96JP9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDHR1Q96JP9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDHR1Q96JP9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CDHR1Q96JP9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDHR1Q96JP9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDHR1Q96JP9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDHR1Q96JP9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDHR1Q96JP9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDHR1Q96JP9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDHR1Q96JP9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDHR1Q96JP9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDHR1Q96JP9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDHR1Q96JP9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDHR1Q96JP9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CDHR1Q96JP9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDHR1Q96JP9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDHR1Q96JP9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CDHR1Q96JP9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDHR1Q96JP9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDHR1Q96JP9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDHR1Q96JP9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CDHR1Q96JP9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDHR1Q96JP9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDHR1Q96JP9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDHR1Q96JP9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDHR1Q96JP9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CDHR1Q96JP9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDHR1Q96JP9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDHR1Q96JP9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CDHR1Q96JP9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDHR1Q96JP9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDHR1Q96JP9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDHR1Q96JP9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDHR1Q96JP9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDHR1Q96JP9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDHR1Q96JP9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDHR1Q96JP9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDHR1Q96JP9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CDHR1Q96JP9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDHR1Q96JP9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDHR1Q96JP9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDHR1Q96JP9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDHR1Q96JP9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CDHR1Q96JP9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDHR1Q96JP9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDHR1Q96JP9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDHR1Q96JP9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDHR1Q96JP9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDHR1Q96JP9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDHR1Q96JP9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDHR1Q96JP9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDHR1Q96JP9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDHR1Q96JP9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDHR1Q96JP9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CDHR1Q96JP9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDHR1Q96JP9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CDHR1Q96JP9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDHR1Q96JP9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDHR1Q96JP9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDHR1Q96JP9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDHR1Q96JP9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDHR1Q96JP9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDHR1Q96JP9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms