Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRIG1Q96JA1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRIG1Q96JA1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LRIG1Q96JA1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRIG1Q96JA1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRIG1Q96JA1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRIG1Q96JA1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRIG1Q96JA1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRIG1Q96JA1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRIG1Q96JA1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRIG1Q96JA1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRIG1Q96JA1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRIG1Q96JA1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRIG1Q96JA1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRIG1Q96JA1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRIG1Q96JA1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRIG1Q96JA1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRIG1Q96JA1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRIG1Q96JA1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRIG1Q96JA1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRIG1Q96JA1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRIG1Q96JA1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRIG1Q96JA1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRIG1Q96JA1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRIG1Q96JA1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRIG1Q96JA1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRIG1Q96JA1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRIG1Q96JA1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRIG1Q96JA1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRIG1Q96JA1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRIG1Q96JA1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRIG1Q96JA1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRIG1Q96JA1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRIG1Q96JA1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRIG1Q96JA1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRIG1Q96JA1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRIG1Q96JA1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRIG1Q96JA1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRIG1Q96JA1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRIG1Q96JA1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRIG1Q96JA1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRIG1Q96JA1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LRIG1Q96JA1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRIG1Q96JA1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRIG1Q96JA1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LRIG1Q96JA1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRIG1Q96JA1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRIG1Q96JA1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRIG1Q96JA1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRIG1Q96JA1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRIG1Q96JA1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRIG1Q96JA1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRIG1Q96JA1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRIG1Q96JA1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRIG1Q96JA1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LRIG1Q96JA1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LRIG1Q96JA1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRIG1Q96JA1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRIG1Q96JA1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRIG1Q96JA1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRIG1Q96JA1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRIG1Q96JA1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRIG1Q96JA1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LRIG1Q96JA1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRIG1Q96JA1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRIG1Q96JA1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRIG1Q96JA1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRIG1Q96JA1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRIG1Q96JA1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LRIG1Q96JA1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRIG1Q96JA1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRIG1Q96JA1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LRIG1Q96JA1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LRIG1Q96JA1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LRIG1Q96JA1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LRIG1Q96JA1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LRIG1Q96JA1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRIG1Q96JA1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRIG1Q96JA1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRIG1Q96JA1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRIG1Q96JA1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRIG1Q96JA1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRIG1Q96JA1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LRIG1Q96JA1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRIG1Q96JA1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRIG1Q96JA1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRIG1Q96JA1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRIG1Q96JA1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRIG1Q96JA1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRIG1Q96JA1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRIG1Q96JA1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LRIG1Q96JA1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRIG1Q96JA1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRIG1Q96JA1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRIG1Q96JA1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRIG1Q96JA1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRIG1Q96JA1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRIG1Q96JA1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LRIG1Q96JA1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRIG1Q96JA1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms