Protein–RNA interactions for Protein: Q96HU1

SGSM3, Small G protein signaling modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM3Q96HU1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGSM3Q96HU1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGSM3Q96HU1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGSM3Q96HU1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGSM3Q96HU1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGSM3Q96HU1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGSM3Q96HU1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGSM3Q96HU1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGSM3Q96HU1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGSM3Q96HU1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGSM3Q96HU1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGSM3Q96HU1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGSM3Q96HU1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGSM3Q96HU1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGSM3Q96HU1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGSM3Q96HU1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SGSM3Q96HU1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGSM3Q96HU1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGSM3Q96HU1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGSM3Q96HU1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGSM3Q96HU1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGSM3Q96HU1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGSM3Q96HU1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGSM3Q96HU1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGSM3Q96HU1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGSM3Q96HU1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGSM3Q96HU1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SGSM3Q96HU1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGSM3Q96HU1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGSM3Q96HU1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SGSM3Q96HU1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SGSM3Q96HU1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SGSM3Q96HU1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SGSM3Q96HU1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SGSM3Q96HU1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SGSM3Q96HU1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SGSM3Q96HU1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SGSM3Q96HU1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SGSM3Q96HU1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SGSM3Q96HU1 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGSM3Q96HU1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGSM3Q96HU1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGSM3Q96HU1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGSM3Q96HU1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGSM3Q96HU1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGSM3Q96HU1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGSM3Q96HU1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SGSM3Q96HU1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGSM3Q96HU1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGSM3Q96HU1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGSM3Q96HU1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SGSM3Q96HU1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SGSM3Q96HU1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SGSM3Q96HU1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SGSM3Q96HU1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SGSM3Q96HU1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SGSM3Q96HU1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SGSM3Q96HU1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SGSM3Q96HU1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGSM3Q96HU1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGSM3Q96HU1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGSM3Q96HU1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGSM3Q96HU1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGSM3Q96HU1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SGSM3Q96HU1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGSM3Q96HU1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SGSM3Q96HU1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGSM3Q96HU1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGSM3Q96HU1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SGSM3Q96HU1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SGSM3Q96HU1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SGSM3Q96HU1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SGSM3Q96HU1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SGSM3Q96HU1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SGSM3Q96HU1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGSM3Q96HU1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGSM3Q96HU1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGSM3Q96HU1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGSM3Q96HU1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SGSM3Q96HU1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGSM3Q96HU1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SGSM3Q96HU1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGSM3Q96HU1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGSM3Q96HU1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGSM3Q96HU1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGSM3Q96HU1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGSM3Q96HU1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SGSM3Q96HU1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SGSM3Q96HU1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SGSM3Q96HU1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SGSM3Q96HU1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SGSM3Q96HU1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SGSM3Q96HU1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SGSM3Q96HU1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SGSM3Q96HU1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SGSM3Q96HU1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SGSM3Q96HU1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SGSM3Q96HU1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SGSM3Q96HU1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGSM3Q96HU1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms