Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MS4A3Q96HJ5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MS4A3Q96HJ5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MS4A3Q96HJ5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MS4A3Q96HJ5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MS4A3Q96HJ5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MS4A3Q96HJ5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MS4A3Q96HJ5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MS4A3Q96HJ5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MS4A3Q96HJ5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MS4A3Q96HJ5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MS4A3Q96HJ5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MS4A3Q96HJ5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MS4A3Q96HJ5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MS4A3Q96HJ5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MS4A3Q96HJ5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MS4A3Q96HJ5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MS4A3Q96HJ5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MS4A3Q96HJ5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MS4A3Q96HJ5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MS4A3Q96HJ5 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MS4A3Q96HJ5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MS4A3Q96HJ5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MS4A3Q96HJ5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MS4A3Q96HJ5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MS4A3Q96HJ5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MS4A3Q96HJ5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MS4A3Q96HJ5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MS4A3Q96HJ5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MS4A3Q96HJ5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MS4A3Q96HJ5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
MS4A3Q96HJ5 AC137695.1-201ENST00000604126 489 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
MS4A3Q96HJ5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MS4A3Q96HJ5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MS4A3Q96HJ5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
MS4A3Q96HJ5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A3Q96HJ5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A3Q96HJ5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A3Q96HJ5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A3Q96HJ5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A3Q96HJ5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A3Q96HJ5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A3Q96HJ5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A3Q96HJ5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A3Q96HJ5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A3Q96HJ5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A3Q96HJ5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A3Q96HJ5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A3Q96HJ5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A3Q96HJ5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A3Q96HJ5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A3Q96HJ5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A3Q96HJ5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A3Q96HJ5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A3Q96HJ5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A3Q96HJ5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A3Q96HJ5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A3Q96HJ5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A3Q96HJ5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A3Q96HJ5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A3Q96HJ5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A3Q96HJ5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A3Q96HJ5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A3Q96HJ5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A3Q96HJ5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A3Q96HJ5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A3Q96HJ5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A3Q96HJ5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MS4A3Q96HJ5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MS4A3Q96HJ5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MS4A3Q96HJ5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MS4A3Q96HJ5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MS4A3Q96HJ5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
MS4A3Q96HJ5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MS4A3Q96HJ5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MS4A3Q96HJ5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MS4A3Q96HJ5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MS4A3Q96HJ5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MS4A3Q96HJ5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MS4A3Q96HJ5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MS4A3Q96HJ5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
MS4A3Q96HJ5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MS4A3Q96HJ5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MS4A3Q96HJ5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MS4A3Q96HJ5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MS4A3Q96HJ5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MS4A3Q96HJ5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MS4A3Q96HJ5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MS4A3Q96HJ5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MS4A3Q96HJ5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MS4A3Q96HJ5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MS4A3Q96HJ5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
MS4A3Q96HJ5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MS4A3Q96HJ5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MS4A3Q96HJ5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MS4A3Q96HJ5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MS4A3Q96HJ5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MS4A3Q96HJ5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MS4A3Q96HJ5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MS4A3Q96HJ5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms