Protein–RNA interactions for Protein: Q96GM5

SMARCD1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD1Q96GM5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCD1Q96GM5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCD1Q96GM5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCD1Q96GM5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCD1Q96GM5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCD1Q96GM5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCD1Q96GM5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCD1Q96GM5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCD1Q96GM5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCD1Q96GM5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCD1Q96GM5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCD1Q96GM5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCD1Q96GM5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCD1Q96GM5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCD1Q96GM5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCD1Q96GM5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCD1Q96GM5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCD1Q96GM5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCD1Q96GM5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCD1Q96GM5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCD1Q96GM5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCD1Q96GM5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCD1Q96GM5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCD1Q96GM5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCD1Q96GM5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCD1Q96GM5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCD1Q96GM5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCD1Q96GM5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCD1Q96GM5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCD1Q96GM5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCD1Q96GM5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCD1Q96GM5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCD1Q96GM5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCD1Q96GM5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCD1Q96GM5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCD1Q96GM5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCD1Q96GM5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCD1Q96GM5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCD1Q96GM5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCD1Q96GM5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCD1Q96GM5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCD1Q96GM5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCD1Q96GM5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCD1Q96GM5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCD1Q96GM5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCD1Q96GM5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCD1Q96GM5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCD1Q96GM5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMARCD1Q96GM5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
SMARCD1Q96GM5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMARCD1Q96GM5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMARCD1Q96GM5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMARCD1Q96GM5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMARCD1Q96GM5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMARCD1Q96GM5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMARCD1Q96GM5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMARCD1Q96GM5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCD1Q96GM5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCD1Q96GM5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCD1Q96GM5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCD1Q96GM5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCD1Q96GM5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCD1Q96GM5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCD1Q96GM5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCD1Q96GM5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCD1Q96GM5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCD1Q96GM5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCD1Q96GM5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCD1Q96GM5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCD1Q96GM5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCD1Q96GM5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCD1Q96GM5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCD1Q96GM5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCD1Q96GM5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCD1Q96GM5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCD1Q96GM5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCD1Q96GM5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCD1Q96GM5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCD1Q96GM5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCD1Q96GM5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCD1Q96GM5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCD1Q96GM5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCD1Q96GM5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCD1Q96GM5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCD1Q96GM5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCD1Q96GM5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCD1Q96GM5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCD1Q96GM5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCD1Q96GM5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCD1Q96GM5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCD1Q96GM5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCD1Q96GM5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCD1Q96GM5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCD1Q96GM5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCD1Q96GM5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCD1Q96GM5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCD1Q96GM5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCD1Q96GM5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCD1Q96GM5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCD1Q96GM5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms