Protein–RNA interactions for Protein: Q96F07

CYFIP2, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP2Q96F07 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYFIP2Q96F07 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYFIP2Q96F07 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYFIP2Q96F07 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYFIP2Q96F07 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYFIP2Q96F07 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYFIP2Q96F07 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYFIP2Q96F07 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CYFIP2Q96F07 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYFIP2Q96F07 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYFIP2Q96F07 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYFIP2Q96F07 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYFIP2Q96F07 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYFIP2Q96F07 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYFIP2Q96F07 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYFIP2Q96F07 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYFIP2Q96F07 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYFIP2Q96F07 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYFIP2Q96F07 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYFIP2Q96F07 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYFIP2Q96F07 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYFIP2Q96F07 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYFIP2Q96F07 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYFIP2Q96F07 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYFIP2Q96F07 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYFIP2Q96F07 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYFIP2Q96F07 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYFIP2Q96F07 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYFIP2Q96F07 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYFIP2Q96F07 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYFIP2Q96F07 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYFIP2Q96F07 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CYFIP2Q96F07 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CYFIP2Q96F07 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CYFIP2Q96F07 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYFIP2Q96F07 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYFIP2Q96F07 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYFIP2Q96F07 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYFIP2Q96F07 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYFIP2Q96F07 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYFIP2Q96F07 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYFIP2Q96F07 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYFIP2Q96F07 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYFIP2Q96F07 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYFIP2Q96F07 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYFIP2Q96F07 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYFIP2Q96F07 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYFIP2Q96F07 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYFIP2Q96F07 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYFIP2Q96F07 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CYFIP2Q96F07 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYFIP2Q96F07 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYFIP2Q96F07 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYFIP2Q96F07 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYFIP2Q96F07 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYFIP2Q96F07 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYFIP2Q96F07 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYFIP2Q96F07 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYFIP2Q96F07 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYFIP2Q96F07 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYFIP2Q96F07 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYFIP2Q96F07 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CYFIP2Q96F07 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYFIP2Q96F07 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYFIP2Q96F07 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CYFIP2Q96F07 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYFIP2Q96F07 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYFIP2Q96F07 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYFIP2Q96F07 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYFIP2Q96F07 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYFIP2Q96F07 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYFIP2Q96F07 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYFIP2Q96F07 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYFIP2Q96F07 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYFIP2Q96F07 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYFIP2Q96F07 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYFIP2Q96F07 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYFIP2Q96F07 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYFIP2Q96F07 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYFIP2Q96F07 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYFIP2Q96F07 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYFIP2Q96F07 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYFIP2Q96F07 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYFIP2Q96F07 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYFIP2Q96F07 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYFIP2Q96F07 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYFIP2Q96F07 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYFIP2Q96F07 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYFIP2Q96F07 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYFIP2Q96F07 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYFIP2Q96F07 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYFIP2Q96F07 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYFIP2Q96F07 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYFIP2Q96F07 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYFIP2Q96F07 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYFIP2Q96F07 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYFIP2Q96F07 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYFIP2Q96F07 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYFIP2Q96F07 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYFIP2Q96F07 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms