Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGF29Q96ES7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGF29Q96ES7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SGF29Q96ES7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGF29Q96ES7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGF29Q96ES7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SGF29Q96ES7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SGF29Q96ES7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SGF29Q96ES7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SGF29Q96ES7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SGF29Q96ES7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SGF29Q96ES7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SGF29Q96ES7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SGF29Q96ES7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SGF29Q96ES7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SGF29Q96ES7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SGF29Q96ES7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SGF29Q96ES7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SGF29Q96ES7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SGF29Q96ES7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SGF29Q96ES7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SGF29Q96ES7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGF29Q96ES7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGF29Q96ES7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGF29Q96ES7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGF29Q96ES7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGF29Q96ES7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGF29Q96ES7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGF29Q96ES7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGF29Q96ES7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SGF29Q96ES7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SGF29Q96ES7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SGF29Q96ES7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SGF29Q96ES7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SGF29Q96ES7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SGF29Q96ES7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SGF29Q96ES7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SGF29Q96ES7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SGF29Q96ES7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SGF29Q96ES7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGF29Q96ES7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGF29Q96ES7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGF29Q96ES7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SGF29Q96ES7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGF29Q96ES7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGF29Q96ES7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SGF29Q96ES7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SGF29Q96ES7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SGF29Q96ES7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SGF29Q96ES7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SGF29Q96ES7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SGF29Q96ES7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SGF29Q96ES7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SGF29Q96ES7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGF29Q96ES7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGF29Q96ES7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGF29Q96ES7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGF29Q96ES7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGF29Q96ES7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGF29Q96ES7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGF29Q96ES7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGF29Q96ES7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGF29Q96ES7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGF29Q96ES7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGF29Q96ES7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGF29Q96ES7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGF29Q96ES7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGF29Q96ES7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGF29Q96ES7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGF29Q96ES7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SGF29Q96ES7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGF29Q96ES7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGF29Q96ES7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGF29Q96ES7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGF29Q96ES7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGF29Q96ES7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGF29Q96ES7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGF29Q96ES7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGF29Q96ES7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGF29Q96ES7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGF29Q96ES7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGF29Q96ES7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGF29Q96ES7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SGF29Q96ES7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGF29Q96ES7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGF29Q96ES7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGF29Q96ES7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGF29Q96ES7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGF29Q96ES7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGF29Q96ES7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGF29Q96ES7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGF29Q96ES7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGF29Q96ES7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGF29Q96ES7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGF29Q96ES7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGF29Q96ES7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGF29Q96ES7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGF29Q96ES7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGF29Q96ES7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGF29Q96ES7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms