Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP0

RNF31, E3 ubiquitin-protein ligase RNF31, humanhuman

Predictions only

Length 1,072 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF31Q96EP0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF31Q96EP0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF31Q96EP0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF31Q96EP0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF31Q96EP0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF31Q96EP0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF31Q96EP0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF31Q96EP0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF31Q96EP0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF31Q96EP0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF31Q96EP0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF31Q96EP0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF31Q96EP0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF31Q96EP0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF31Q96EP0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF31Q96EP0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF31Q96EP0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF31Q96EP0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF31Q96EP0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF31Q96EP0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF31Q96EP0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF31Q96EP0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF31Q96EP0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF31Q96EP0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF31Q96EP0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF31Q96EP0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF31Q96EP0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF31Q96EP0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF31Q96EP0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF31Q96EP0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF31Q96EP0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF31Q96EP0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RNF31Q96EP0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF31Q96EP0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF31Q96EP0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF31Q96EP0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF31Q96EP0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF31Q96EP0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF31Q96EP0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF31Q96EP0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF31Q96EP0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF31Q96EP0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF31Q96EP0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF31Q96EP0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF31Q96EP0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF31Q96EP0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF31Q96EP0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF31Q96EP0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF31Q96EP0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF31Q96EP0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF31Q96EP0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF31Q96EP0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF31Q96EP0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF31Q96EP0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF31Q96EP0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF31Q96EP0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF31Q96EP0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF31Q96EP0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF31Q96EP0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF31Q96EP0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF31Q96EP0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF31Q96EP0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF31Q96EP0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF31Q96EP0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF31Q96EP0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF31Q96EP0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF31Q96EP0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF31Q96EP0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF31Q96EP0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF31Q96EP0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF31Q96EP0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF31Q96EP0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF31Q96EP0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF31Q96EP0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF31Q96EP0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF31Q96EP0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF31Q96EP0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF31Q96EP0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF31Q96EP0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF31Q96EP0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF31Q96EP0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF31Q96EP0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF31Q96EP0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF31Q96EP0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF31Q96EP0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF31Q96EP0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RNF31Q96EP0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RNF31Q96EP0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RNF31Q96EP0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RNF31Q96EP0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF31Q96EP0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF31Q96EP0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF31Q96EP0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF31Q96EP0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF31Q96EP0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF31Q96EP0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF31Q96EP0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF31Q96EP0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF31Q96EP0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF31Q96EP0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 782.9 ms