Protein–RNA interactions for Protein: Q96EN9

C19orf60, Uncharacterized protein C19orf60, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C19orf60Q96EN9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C19orf60Q96EN9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C19orf60Q96EN9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C19orf60Q96EN9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C19orf60Q96EN9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C19orf60Q96EN9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C19orf60Q96EN9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C19orf60Q96EN9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C19orf60Q96EN9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C19orf60Q96EN9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C19orf60Q96EN9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C19orf60Q96EN9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
C19orf60Q96EN9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C19orf60Q96EN9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C19orf60Q96EN9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C19orf60Q96EN9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C19orf60Q96EN9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C19orf60Q96EN9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C19orf60Q96EN9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C19orf60Q96EN9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C19orf60Q96EN9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C19orf60Q96EN9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C19orf60Q96EN9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C19orf60Q96EN9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C19orf60Q96EN9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C19orf60Q96EN9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C19orf60Q96EN9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C19orf60Q96EN9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C19orf60Q96EN9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C19orf60Q96EN9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C19orf60Q96EN9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C19orf60Q96EN9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C19orf60Q96EN9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C19orf60Q96EN9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C19orf60Q96EN9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C19orf60Q96EN9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C19orf60Q96EN9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C19orf60Q96EN9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
C19orf60Q96EN9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C19orf60Q96EN9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C19orf60Q96EN9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C19orf60Q96EN9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
C19orf60Q96EN9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C19orf60Q96EN9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C19orf60Q96EN9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C19orf60Q96EN9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C19orf60Q96EN9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C19orf60Q96EN9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C19orf60Q96EN9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C19orf60Q96EN9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C19orf60Q96EN9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C19orf60Q96EN9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C19orf60Q96EN9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C19orf60Q96EN9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C19orf60Q96EN9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C19orf60Q96EN9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C19orf60Q96EN9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C19orf60Q96EN9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C19orf60Q96EN9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C19orf60Q96EN9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
C19orf60Q96EN9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C19orf60Q96EN9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C19orf60Q96EN9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C19orf60Q96EN9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C19orf60Q96EN9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C19orf60Q96EN9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C19orf60Q96EN9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C19orf60Q96EN9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C19orf60Q96EN9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C19orf60Q96EN9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C19orf60Q96EN9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C19orf60Q96EN9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C19orf60Q96EN9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C19orf60Q96EN9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C19orf60Q96EN9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C19orf60Q96EN9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C19orf60Q96EN9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C19orf60Q96EN9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C19orf60Q96EN9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C19orf60Q96EN9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C19orf60Q96EN9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C19orf60Q96EN9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C19orf60Q96EN9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C19orf60Q96EN9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C19orf60Q96EN9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C19orf60Q96EN9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C19orf60Q96EN9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C19orf60Q96EN9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C19orf60Q96EN9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C19orf60Q96EN9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C19orf60Q96EN9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
C19orf60Q96EN9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C19orf60Q96EN9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C19orf60Q96EN9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C19orf60Q96EN9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C19orf60Q96EN9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C19orf60Q96EN9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C19orf60Q96EN9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C19orf60Q96EN9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C19orf60Q96EN9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms