Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH5

RPL39L, 60S ribosomal protein L39-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39LQ96EH5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL39LQ96EH5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL39LQ96EH5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL39LQ96EH5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL39LQ96EH5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL39LQ96EH5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL39LQ96EH5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL39LQ96EH5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL39LQ96EH5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL39LQ96EH5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL39LQ96EH5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL39LQ96EH5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL39LQ96EH5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL39LQ96EH5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL39LQ96EH5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL39LQ96EH5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL39LQ96EH5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL39LQ96EH5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL39LQ96EH5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL39LQ96EH5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL39LQ96EH5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL39LQ96EH5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL39LQ96EH5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL39LQ96EH5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL39LQ96EH5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL39LQ96EH5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL39LQ96EH5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL39LQ96EH5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL39LQ96EH5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL39LQ96EH5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL39LQ96EH5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL39LQ96EH5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL39LQ96EH5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL39LQ96EH5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL39LQ96EH5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL39LQ96EH5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL39LQ96EH5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL39LQ96EH5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL39LQ96EH5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL39LQ96EH5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL39LQ96EH5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL39LQ96EH5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL39LQ96EH5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL39LQ96EH5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL39LQ96EH5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL39LQ96EH5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL39LQ96EH5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL39LQ96EH5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL39LQ96EH5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL39LQ96EH5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL39LQ96EH5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL39LQ96EH5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL39LQ96EH5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL39LQ96EH5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL39LQ96EH5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL39LQ96EH5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL39LQ96EH5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL39LQ96EH5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL39LQ96EH5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL39LQ96EH5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL39LQ96EH5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL39LQ96EH5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL39LQ96EH5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL39LQ96EH5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL39LQ96EH5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL39LQ96EH5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL39LQ96EH5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL39LQ96EH5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL39LQ96EH5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL39LQ96EH5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL39LQ96EH5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL39LQ96EH5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL39LQ96EH5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL39LQ96EH5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL39LQ96EH5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL39LQ96EH5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL39LQ96EH5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL39LQ96EH5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL39LQ96EH5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL39LQ96EH5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL39LQ96EH5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL39LQ96EH5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL39LQ96EH5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL39LQ96EH5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL39LQ96EH5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL39LQ96EH5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL39LQ96EH5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL39LQ96EH5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL39LQ96EH5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL39LQ96EH5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL39LQ96EH5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL39LQ96EH5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL39LQ96EH5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL39LQ96EH5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL39LQ96EH5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL39LQ96EH5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL39LQ96EH5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL39LQ96EH5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL39LQ96EH5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL39LQ96EH5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms