Protein–RNA interactions for Protein: Q96E52

OMA1, Metalloendopeptidase OMA1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OMA1Q96E52 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OMA1Q96E52 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OMA1Q96E52 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OMA1Q96E52 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OMA1Q96E52 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OMA1Q96E52 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
OMA1Q96E52 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.31■■□□□ 1
OMA1Q96E52 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OMA1Q96E52 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OMA1Q96E52 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
OMA1Q96E52 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
OMA1Q96E52 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
OMA1Q96E52 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OMA1Q96E52 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OMA1Q96E52 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OMA1Q96E52 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OMA1Q96E52 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
OMA1Q96E52 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OMA1Q96E52 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
OMA1Q96E52 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OMA1Q96E52 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OMA1Q96E52 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
OMA1Q96E52 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OMA1Q96E52 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
OMA1Q96E52 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
OMA1Q96E52 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
OMA1Q96E52 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
OMA1Q96E52 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.29■■□□□ 1
OMA1Q96E52 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
OMA1Q96E52 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OMA1Q96E52 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OMA1Q96E52 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OMA1Q96E52 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
OMA1Q96E52 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OMA1Q96E52 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OMA1Q96E52 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
OMA1Q96E52 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OMA1Q96E52 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OMA1Q96E52 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
OMA1Q96E52 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
OMA1Q96E52 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.28■■□□□ 1
OMA1Q96E52 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OMA1Q96E52 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.27■■□□□ 1
OMA1Q96E52 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OMA1Q96E52 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OMA1Q96E52 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OMA1Q96E52 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
OMA1Q96E52 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
OMA1Q96E52 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
OMA1Q96E52 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
OMA1Q96E52 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
OMA1Q96E52 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
OMA1Q96E52 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OMA1Q96E52 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
OMA1Q96E52 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
OMA1Q96E52 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
OMA1Q96E52 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
OMA1Q96E52 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
OMA1Q96E52 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
OMA1Q96E52 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
OMA1Q96E52 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
OMA1Q96E52 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
OMA1Q96E52 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
OMA1Q96E52 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
OMA1Q96E52 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
OMA1Q96E52 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
OMA1Q96E52 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
OMA1Q96E52 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
OMA1Q96E52 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
OMA1Q96E52 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
OMA1Q96E52 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
OMA1Q96E52 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
OMA1Q96E52 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
OMA1Q96E52 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
OMA1Q96E52 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
OMA1Q96E52 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
OMA1Q96E52 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
OMA1Q96E52 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
OMA1Q96E52 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
OMA1Q96E52 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
OMA1Q96E52 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
OMA1Q96E52 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
OMA1Q96E52 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
OMA1Q96E52 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
OMA1Q96E52 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
OMA1Q96E52 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
OMA1Q96E52 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
OMA1Q96E52 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
OMA1Q96E52 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
OMA1Q96E52 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
OMA1Q96E52 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
OMA1Q96E52 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
OMA1Q96E52 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
OMA1Q96E52 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
OMA1Q96E52 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
OMA1Q96E52 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
OMA1Q96E52 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
OMA1Q96E52 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
OMA1Q96E52 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
OMA1Q96E52 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms