Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD7

SHISA4, Protein shisa-4, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA4Q96DD7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SHISA4Q96DD7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SHISA4Q96DD7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SHISA4Q96DD7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SHISA4Q96DD7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SHISA4Q96DD7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SHISA4Q96DD7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SHISA4Q96DD7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SHISA4Q96DD7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SHISA4Q96DD7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SHISA4Q96DD7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SHISA4Q96DD7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SHISA4Q96DD7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SHISA4Q96DD7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SHISA4Q96DD7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SHISA4Q96DD7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SHISA4Q96DD7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SHISA4Q96DD7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SHISA4Q96DD7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SHISA4Q96DD7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SHISA4Q96DD7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SHISA4Q96DD7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SHISA4Q96DD7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SHISA4Q96DD7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SHISA4Q96DD7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SHISA4Q96DD7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SHISA4Q96DD7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SHISA4Q96DD7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SHISA4Q96DD7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SHISA4Q96DD7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SHISA4Q96DD7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SHISA4Q96DD7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SHISA4Q96DD7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SHISA4Q96DD7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SHISA4Q96DD7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SHISA4Q96DD7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SHISA4Q96DD7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SHISA4Q96DD7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SHISA4Q96DD7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SHISA4Q96DD7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SHISA4Q96DD7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SHISA4Q96DD7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SHISA4Q96DD7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SHISA4Q96DD7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SHISA4Q96DD7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SHISA4Q96DD7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SHISA4Q96DD7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SHISA4Q96DD7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SHISA4Q96DD7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SHISA4Q96DD7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SHISA4Q96DD7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SHISA4Q96DD7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SHISA4Q96DD7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SHISA4Q96DD7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SHISA4Q96DD7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SHISA4Q96DD7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SHISA4Q96DD7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SHISA4Q96DD7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SHISA4Q96DD7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SHISA4Q96DD7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SHISA4Q96DD7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SHISA4Q96DD7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SHISA4Q96DD7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SHISA4Q96DD7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SHISA4Q96DD7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SHISA4Q96DD7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SHISA4Q96DD7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SHISA4Q96DD7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SHISA4Q96DD7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SHISA4Q96DD7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SHISA4Q96DD7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SHISA4Q96DD7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SHISA4Q96DD7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SHISA4Q96DD7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SHISA4Q96DD7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SHISA4Q96DD7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SHISA4Q96DD7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SHISA4Q96DD7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SHISA4Q96DD7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SHISA4Q96DD7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SHISA4Q96DD7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SHISA4Q96DD7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SHISA4Q96DD7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SHISA4Q96DD7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SHISA4Q96DD7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SHISA4Q96DD7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SHISA4Q96DD7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHISA4Q96DD7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHISA4Q96DD7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHISA4Q96DD7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SHISA4Q96DD7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SHISA4Q96DD7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHISA4Q96DD7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHISA4Q96DD7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHISA4Q96DD7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SHISA4Q96DD7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SHISA4Q96DD7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHISA4Q96DD7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHISA4Q96DD7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHISA4Q96DD7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms