Protein–RNA interactions for Protein: Q969I6

SLC38A4, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A4Q969I6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC38A4Q969I6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC38A4Q969I6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC38A4Q969I6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC38A4Q969I6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC38A4Q969I6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC38A4Q969I6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC38A4Q969I6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC38A4Q969I6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC38A4Q969I6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC38A4Q969I6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC38A4Q969I6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC38A4Q969I6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC38A4Q969I6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC38A4Q969I6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC38A4Q969I6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC38A4Q969I6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SLC38A4Q969I6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC38A4Q969I6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC38A4Q969I6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC38A4Q969I6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC38A4Q969I6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC38A4Q969I6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC38A4Q969I6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC38A4Q969I6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC38A4Q969I6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC38A4Q969I6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC38A4Q969I6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC38A4Q969I6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC38A4Q969I6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC38A4Q969I6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC38A4Q969I6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC38A4Q969I6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC38A4Q969I6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC38A4Q969I6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC38A4Q969I6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC38A4Q969I6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC38A4Q969I6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC38A4Q969I6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC38A4Q969I6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC38A4Q969I6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC38A4Q969I6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC38A4Q969I6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC38A4Q969I6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC38A4Q969I6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC38A4Q969I6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC38A4Q969I6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC38A4Q969I6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC38A4Q969I6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC38A4Q969I6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC38A4Q969I6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC38A4Q969I6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC38A4Q969I6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC38A4Q969I6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC38A4Q969I6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC38A4Q969I6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC38A4Q969I6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC38A4Q969I6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC38A4Q969I6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC38A4Q969I6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC38A4Q969I6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC38A4Q969I6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC38A4Q969I6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC38A4Q969I6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC38A4Q969I6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC38A4Q969I6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC38A4Q969I6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC38A4Q969I6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC38A4Q969I6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC38A4Q969I6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC38A4Q969I6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC38A4Q969I6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC38A4Q969I6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC38A4Q969I6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC38A4Q969I6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC38A4Q969I6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC38A4Q969I6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC38A4Q969I6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC38A4Q969I6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC38A4Q969I6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC38A4Q969I6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC38A4Q969I6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC38A4Q969I6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC38A4Q969I6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC38A4Q969I6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC38A4Q969I6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC38A4Q969I6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC38A4Q969I6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC38A4Q969I6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC38A4Q969I6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC38A4Q969I6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC38A4Q969I6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC38A4Q969I6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC38A4Q969I6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC38A4Q969I6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC38A4Q969I6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC38A4Q969I6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC38A4Q969I6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC38A4Q969I6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC38A4Q969I6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms