Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BHMTQ93088 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BHMTQ93088 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
BHMTQ93088 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BHMTQ93088 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BHMTQ93088 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BHMTQ93088 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BHMTQ93088 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BHMTQ93088 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BHMTQ93088 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BHMTQ93088 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BHMTQ93088 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BHMTQ93088 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BHMTQ93088 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BHMTQ93088 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BHMTQ93088 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BHMTQ93088 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
BHMTQ93088 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
BHMTQ93088 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
BHMTQ93088 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
BHMTQ93088 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BHMTQ93088 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BHMTQ93088 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BHMTQ93088 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BHMTQ93088 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BHMTQ93088 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BHMTQ93088 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
BHMTQ93088 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BHMTQ93088 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BHMTQ93088 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BHMTQ93088 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BHMTQ93088 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BHMTQ93088 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
BHMTQ93088 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BHMTQ93088 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BHMTQ93088 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BHMTQ93088 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BHMTQ93088 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BHMTQ93088 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BHMTQ93088 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BHMTQ93088 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BHMTQ93088 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BHMTQ93088 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
BHMTQ93088 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BHMTQ93088 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BHMTQ93088 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BHMTQ93088 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BHMTQ93088 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BHMTQ93088 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BHMTQ93088 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BHMTQ93088 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BHMTQ93088 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BHMTQ93088 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BHMTQ93088 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BHMTQ93088 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BHMTQ93088 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
BHMTQ93088 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BHMTQ93088 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BHMTQ93088 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BHMTQ93088 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BHMTQ93088 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BHMTQ93088 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BHMTQ93088 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BHMTQ93088 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BHMTQ93088 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BHMTQ93088 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
BHMTQ93088 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BHMTQ93088 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BHMTQ93088 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BHMTQ93088 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BHMTQ93088 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BHMTQ93088 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BHMTQ93088 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BHMTQ93088 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BHMTQ93088 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BHMTQ93088 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BHMTQ93088 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BHMTQ93088 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BHMTQ93088 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BHMTQ93088 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BHMTQ93088 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BHMTQ93088 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BHMTQ93088 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BHMTQ93088 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BHMTQ93088 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BHMTQ93088 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BHMTQ93088 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BHMTQ93088 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BHMTQ93088 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BHMTQ93088 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BHMTQ93088 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BHMTQ93088 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BHMTQ93088 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BHMTQ93088 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BHMTQ93088 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BHMTQ93088 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BHMTQ93088 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BHMTQ93088 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BHMTQ93088 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BHMTQ93088 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms