Protein–RNA interactions for Protein: Q93009

USP7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP7Q93009 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP7Q93009 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP7Q93009 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP7Q93009 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP7Q93009 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP7Q93009 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP7Q93009 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
USP7Q93009 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
USP7Q93009 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
USP7Q93009 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
USP7Q93009 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP7Q93009 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP7Q93009 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP7Q93009 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP7Q93009 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP7Q93009 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP7Q93009 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP7Q93009 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP7Q93009 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
USP7Q93009 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
USP7Q93009 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
USP7Q93009 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP7Q93009 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
USP7Q93009 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP7Q93009 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP7Q93009 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP7Q93009 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP7Q93009 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP7Q93009 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP7Q93009 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP7Q93009 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP7Q93009 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP7Q93009 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP7Q93009 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP7Q93009 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP7Q93009 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
USP7Q93009 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP7Q93009 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP7Q93009 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP7Q93009 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP7Q93009 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP7Q93009 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP7Q93009 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP7Q93009 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP7Q93009 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP7Q93009 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP7Q93009 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP7Q93009 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP7Q93009 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP7Q93009 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP7Q93009 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP7Q93009 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP7Q93009 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP7Q93009 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP7Q93009 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP7Q93009 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP7Q93009 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP7Q93009 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP7Q93009 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
USP7Q93009 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP7Q93009 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP7Q93009 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP7Q93009 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP7Q93009 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP7Q93009 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP7Q93009 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP7Q93009 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP7Q93009 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP7Q93009 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP7Q93009 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
USP7Q93009 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
USP7Q93009 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP7Q93009 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP7Q93009 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP7Q93009 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP7Q93009 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP7Q93009 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP7Q93009 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP7Q93009 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP7Q93009 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP7Q93009 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP7Q93009 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP7Q93009 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP7Q93009 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP7Q93009 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP7Q93009 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP7Q93009 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP7Q93009 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP7Q93009 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP7Q93009 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP7Q93009 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP7Q93009 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP7Q93009 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP7Q93009 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP7Q93009 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP7Q93009 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP7Q93009 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP7Q93009 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP7Q93009 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP7Q93009 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.5 ms