Protein–RNA interactions for Protein: Q92753

RORB, Nuclear receptor ROR-beta, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORBQ92753 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RORBQ92753 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RORBQ92753 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RORBQ92753 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RORBQ92753 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RORBQ92753 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RORBQ92753 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RORBQ92753 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RORBQ92753 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RORBQ92753 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RORBQ92753 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RORBQ92753 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RORBQ92753 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RORBQ92753 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
RORBQ92753 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RORBQ92753 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RORBQ92753 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
RORBQ92753 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RORBQ92753 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RORBQ92753 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RORBQ92753 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RORBQ92753 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RORBQ92753 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RORBQ92753 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RORBQ92753 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RORBQ92753 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RORBQ92753 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RORBQ92753 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RORBQ92753 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RORBQ92753 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RORBQ92753 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RORBQ92753 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RORBQ92753 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RORBQ92753 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RORBQ92753 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RORBQ92753 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RORBQ92753 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RORBQ92753 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RORBQ92753 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RORBQ92753 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RORBQ92753 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RORBQ92753 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RORBQ92753 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RORBQ92753 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RORBQ92753 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RORBQ92753 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RORBQ92753 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RORBQ92753 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RORBQ92753 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RORBQ92753 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RORBQ92753 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
RORBQ92753 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RORBQ92753 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RORBQ92753 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RORBQ92753 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RORBQ92753 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
RORBQ92753 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RORBQ92753 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RORBQ92753 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RORBQ92753 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RORBQ92753 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RORBQ92753 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RORBQ92753 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RORBQ92753 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RORBQ92753 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RORBQ92753 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RORBQ92753 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RORBQ92753 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RORBQ92753 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RORBQ92753 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RORBQ92753 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RORBQ92753 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RORBQ92753 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RORBQ92753 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RORBQ92753 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
RORBQ92753 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RORBQ92753 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RORBQ92753 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RORBQ92753 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RORBQ92753 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RORBQ92753 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RORBQ92753 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RORBQ92753 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
RORBQ92753 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RORBQ92753 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RORBQ92753 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RORBQ92753 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RORBQ92753 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RORBQ92753 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RORBQ92753 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RORBQ92753 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
RORBQ92753 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RORBQ92753 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RORBQ92753 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RORBQ92753 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RORBQ92753 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RORBQ92753 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
RORBQ92753 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RORBQ92753 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RORBQ92753 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms