Protein–RNA interactions for Protein: Q92581

SLC9A6, Sodium/hydrogen exchanger 6, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A6Q92581 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A6Q92581 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC9A6Q92581 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC9A6Q92581 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC9A6Q92581 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC9A6Q92581 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC9A6Q92581 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC9A6Q92581 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC9A6Q92581 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC9A6Q92581 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC9A6Q92581 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC9A6Q92581 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC9A6Q92581 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC9A6Q92581 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC9A6Q92581 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC9A6Q92581 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC9A6Q92581 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC9A6Q92581 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC9A6Q92581 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC9A6Q92581 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC9A6Q92581 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC9A6Q92581 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC9A6Q92581 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC9A6Q92581 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC9A6Q92581 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC9A6Q92581 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC9A6Q92581 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC9A6Q92581 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC9A6Q92581 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC9A6Q92581 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC9A6Q92581 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC9A6Q92581 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC9A6Q92581 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC9A6Q92581 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC9A6Q92581 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC9A6Q92581 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC9A6Q92581 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC9A6Q92581 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC9A6Q92581 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC9A6Q92581 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC9A6Q92581 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC9A6Q92581 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC9A6Q92581 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC9A6Q92581 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC9A6Q92581 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC9A6Q92581 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC9A6Q92581 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC9A6Q92581 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC9A6Q92581 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC9A6Q92581 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC9A6Q92581 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC9A6Q92581 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC9A6Q92581 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC9A6Q92581 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC9A6Q92581 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC9A6Q92581 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC9A6Q92581 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC9A6Q92581 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9A6Q92581 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9A6Q92581 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9A6Q92581 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9A6Q92581 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9A6Q92581 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9A6Q92581 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9A6Q92581 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A6Q92581 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A6Q92581 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A6Q92581 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A6Q92581 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A6Q92581 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A6Q92581 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A6Q92581 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A6Q92581 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A6Q92581 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A6Q92581 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A6Q92581 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A6Q92581 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A6Q92581 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A6Q92581 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A6Q92581 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A6Q92581 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A6Q92581 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A6Q92581 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A6Q92581 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A6Q92581 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A6Q92581 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A6Q92581 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A6Q92581 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A6Q92581 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A6Q92581 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A6Q92581 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC9A6Q92581 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC9A6Q92581 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC9A6Q92581 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC9A6Q92581 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC9A6Q92581 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC9A6Q92581 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SLC9A6Q92581 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A6Q92581 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A6Q92581 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms