Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ73

RFFL, E3 ubiquitin-protein ligase rififylin, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFFLQ8WZ73 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFFLQ8WZ73 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFFLQ8WZ73 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFFLQ8WZ73 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RFFLQ8WZ73 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFFLQ8WZ73 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFFLQ8WZ73 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFFLQ8WZ73 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFFLQ8WZ73 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFFLQ8WZ73 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFFLQ8WZ73 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RFFLQ8WZ73 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFFLQ8WZ73 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFFLQ8WZ73 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFFLQ8WZ73 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFFLQ8WZ73 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFFLQ8WZ73 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFFLQ8WZ73 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFFLQ8WZ73 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFFLQ8WZ73 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFFLQ8WZ73 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFFLQ8WZ73 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFFLQ8WZ73 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RFFLQ8WZ73 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFFLQ8WZ73 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFFLQ8WZ73 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFFLQ8WZ73 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFFLQ8WZ73 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFFLQ8WZ73 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFFLQ8WZ73 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFFLQ8WZ73 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFFLQ8WZ73 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFFLQ8WZ73 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFFLQ8WZ73 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFFLQ8WZ73 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFFLQ8WZ73 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RFFLQ8WZ73 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFFLQ8WZ73 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFFLQ8WZ73 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFFLQ8WZ73 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFFLQ8WZ73 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFFLQ8WZ73 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFFLQ8WZ73 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFFLQ8WZ73 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFFLQ8WZ73 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFFLQ8WZ73 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFFLQ8WZ73 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFFLQ8WZ73 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFFLQ8WZ73 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFFLQ8WZ73 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFFLQ8WZ73 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFFLQ8WZ73 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFFLQ8WZ73 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFFLQ8WZ73 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFFLQ8WZ73 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFFLQ8WZ73 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFFLQ8WZ73 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFFLQ8WZ73 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFFLQ8WZ73 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFFLQ8WZ73 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFFLQ8WZ73 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFFLQ8WZ73 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFFLQ8WZ73 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFFLQ8WZ73 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFFLQ8WZ73 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFFLQ8WZ73 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFFLQ8WZ73 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFFLQ8WZ73 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFFLQ8WZ73 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RFFLQ8WZ73 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFFLQ8WZ73 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFFLQ8WZ73 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFFLQ8WZ73 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFFLQ8WZ73 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFFLQ8WZ73 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFFLQ8WZ73 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFFLQ8WZ73 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFFLQ8WZ73 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFFLQ8WZ73 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFFLQ8WZ73 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFFLQ8WZ73 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFFLQ8WZ73 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFFLQ8WZ73 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFFLQ8WZ73 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFFLQ8WZ73 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFFLQ8WZ73 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RFFLQ8WZ73 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RFFLQ8WZ73 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFFLQ8WZ73 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFFLQ8WZ73 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFFLQ8WZ73 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RFFLQ8WZ73 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RFFLQ8WZ73 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFFLQ8WZ73 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFFLQ8WZ73 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFFLQ8WZ73 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFFLQ8WZ73 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFFLQ8WZ73 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFFLQ8WZ73 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFFLQ8WZ73 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms