Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF1

PSPC1, Paraspeckle component 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1Q8WXF1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSPC1Q8WXF1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSPC1Q8WXF1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSPC1Q8WXF1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSPC1Q8WXF1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSPC1Q8WXF1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSPC1Q8WXF1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSPC1Q8WXF1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSPC1Q8WXF1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSPC1Q8WXF1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSPC1Q8WXF1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSPC1Q8WXF1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSPC1Q8WXF1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSPC1Q8WXF1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSPC1Q8WXF1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSPC1Q8WXF1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSPC1Q8WXF1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSPC1Q8WXF1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSPC1Q8WXF1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSPC1Q8WXF1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSPC1Q8WXF1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSPC1Q8WXF1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSPC1Q8WXF1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSPC1Q8WXF1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSPC1Q8WXF1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSPC1Q8WXF1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PSPC1Q8WXF1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSPC1Q8WXF1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSPC1Q8WXF1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSPC1Q8WXF1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PSPC1Q8WXF1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSPC1Q8WXF1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSPC1Q8WXF1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSPC1Q8WXF1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSPC1Q8WXF1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PSPC1Q8WXF1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PSPC1Q8WXF1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSPC1Q8WXF1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSPC1Q8WXF1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSPC1Q8WXF1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSPC1Q8WXF1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSPC1Q8WXF1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSPC1Q8WXF1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PSPC1Q8WXF1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSPC1Q8WXF1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSPC1Q8WXF1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSPC1Q8WXF1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSPC1Q8WXF1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSPC1Q8WXF1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSPC1Q8WXF1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSPC1Q8WXF1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSPC1Q8WXF1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSPC1Q8WXF1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSPC1Q8WXF1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSPC1Q8WXF1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSPC1Q8WXF1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSPC1Q8WXF1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSPC1Q8WXF1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSPC1Q8WXF1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSPC1Q8WXF1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSPC1Q8WXF1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSPC1Q8WXF1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSPC1Q8WXF1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSPC1Q8WXF1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSPC1Q8WXF1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSPC1Q8WXF1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSPC1Q8WXF1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSPC1Q8WXF1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSPC1Q8WXF1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSPC1Q8WXF1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSPC1Q8WXF1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSPC1Q8WXF1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSPC1Q8WXF1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSPC1Q8WXF1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSPC1Q8WXF1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSPC1Q8WXF1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSPC1Q8WXF1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSPC1Q8WXF1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSPC1Q8WXF1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSPC1Q8WXF1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSPC1Q8WXF1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PSPC1Q8WXF1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSPC1Q8WXF1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSPC1Q8WXF1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSPC1Q8WXF1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSPC1Q8WXF1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSPC1Q8WXF1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSPC1Q8WXF1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSPC1Q8WXF1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSPC1Q8WXF1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSPC1Q8WXF1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSPC1Q8WXF1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSPC1Q8WXF1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSPC1Q8WXF1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSPC1Q8WXF1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSPC1Q8WXF1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSPC1Q8WXF1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSPC1Q8WXF1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSPC1Q8WXF1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSPC1Q8WXF1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
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