Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVF5

KCTD4, BTB/POZ domain-containing protein KCTD4, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD4Q8WVF5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCTD4Q8WVF5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCTD4Q8WVF5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCTD4Q8WVF5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCTD4Q8WVF5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCTD4Q8WVF5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCTD4Q8WVF5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCTD4Q8WVF5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCTD4Q8WVF5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KCTD4Q8WVF5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KCTD4Q8WVF5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KCTD4Q8WVF5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KCTD4Q8WVF5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
KCTD4Q8WVF5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCTD4Q8WVF5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
KCTD4Q8WVF5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCTD4Q8WVF5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCTD4Q8WVF5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCTD4Q8WVF5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCTD4Q8WVF5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCTD4Q8WVF5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCTD4Q8WVF5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCTD4Q8WVF5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCTD4Q8WVF5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCTD4Q8WVF5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCTD4Q8WVF5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCTD4Q8WVF5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCTD4Q8WVF5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCTD4Q8WVF5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCTD4Q8WVF5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCTD4Q8WVF5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCTD4Q8WVF5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCTD4Q8WVF5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCTD4Q8WVF5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCTD4Q8WVF5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCTD4Q8WVF5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCTD4Q8WVF5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCTD4Q8WVF5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCTD4Q8WVF5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCTD4Q8WVF5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCTD4Q8WVF5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KCTD4Q8WVF5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCTD4Q8WVF5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCTD4Q8WVF5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCTD4Q8WVF5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCTD4Q8WVF5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KCTD4Q8WVF5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCTD4Q8WVF5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCTD4Q8WVF5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCTD4Q8WVF5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCTD4Q8WVF5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCTD4Q8WVF5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KCTD4Q8WVF5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCTD4Q8WVF5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCTD4Q8WVF5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCTD4Q8WVF5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCTD4Q8WVF5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCTD4Q8WVF5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCTD4Q8WVF5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCTD4Q8WVF5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCTD4Q8WVF5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCTD4Q8WVF5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCTD4Q8WVF5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCTD4Q8WVF5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KCTD4Q8WVF5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCTD4Q8WVF5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCTD4Q8WVF5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCTD4Q8WVF5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCTD4Q8WVF5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCTD4Q8WVF5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCTD4Q8WVF5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCTD4Q8WVF5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KCTD4Q8WVF5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCTD4Q8WVF5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCTD4Q8WVF5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KCTD4Q8WVF5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KCTD4Q8WVF5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KCTD4Q8WVF5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KCTD4Q8WVF5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCTD4Q8WVF5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCTD4Q8WVF5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCTD4Q8WVF5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCTD4Q8WVF5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCTD4Q8WVF5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCTD4Q8WVF5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCTD4Q8WVF5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCTD4Q8WVF5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCTD4Q8WVF5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCTD4Q8WVF5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCTD4Q8WVF5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCTD4Q8WVF5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCTD4Q8WVF5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCTD4Q8WVF5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCTD4Q8WVF5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCTD4Q8WVF5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCTD4Q8WVF5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KCTD4Q8WVF5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCTD4Q8WVF5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCTD4Q8WVF5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCTD4Q8WVF5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms