Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KLHDC4Q8TBB5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KLHDC4Q8TBB5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KLHDC4Q8TBB5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KLHDC4Q8TBB5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KLHDC4Q8TBB5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KLHDC4Q8TBB5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KLHDC4Q8TBB5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KLHDC4Q8TBB5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KLHDC4Q8TBB5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
KLHDC4Q8TBB5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KLHDC4Q8TBB5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KLHDC4Q8TBB5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KLHDC4Q8TBB5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KLHDC4Q8TBB5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KLHDC4Q8TBB5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KLHDC4Q8TBB5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KLHDC4Q8TBB5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KLHDC4Q8TBB5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KLHDC4Q8TBB5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KLHDC4Q8TBB5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KLHDC4Q8TBB5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KLHDC4Q8TBB5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KLHDC4Q8TBB5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KLHDC4Q8TBB5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KLHDC4Q8TBB5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KLHDC4Q8TBB5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KLHDC4Q8TBB5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KLHDC4Q8TBB5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KLHDC4Q8TBB5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KLHDC4Q8TBB5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KLHDC4Q8TBB5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KLHDC4Q8TBB5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KLHDC4Q8TBB5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KLHDC4Q8TBB5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KLHDC4Q8TBB5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KLHDC4Q8TBB5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KLHDC4Q8TBB5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KLHDC4Q8TBB5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KLHDC4Q8TBB5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KLHDC4Q8TBB5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KLHDC4Q8TBB5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KLHDC4Q8TBB5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KLHDC4Q8TBB5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KLHDC4Q8TBB5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KLHDC4Q8TBB5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
KLHDC4Q8TBB5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KLHDC4Q8TBB5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KLHDC4Q8TBB5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KLHDC4Q8TBB5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KLHDC4Q8TBB5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KLHDC4Q8TBB5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KLHDC4Q8TBB5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KLHDC4Q8TBB5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KLHDC4Q8TBB5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KLHDC4Q8TBB5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KLHDC4Q8TBB5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KLHDC4Q8TBB5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KLHDC4Q8TBB5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KLHDC4Q8TBB5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KLHDC4Q8TBB5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KLHDC4Q8TBB5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KLHDC4Q8TBB5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KLHDC4Q8TBB5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KLHDC4Q8TBB5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KLHDC4Q8TBB5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KLHDC4Q8TBB5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KLHDC4Q8TBB5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KLHDC4Q8TBB5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KLHDC4Q8TBB5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KLHDC4Q8TBB5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KLHDC4Q8TBB5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KLHDC4Q8TBB5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
KLHDC4Q8TBB5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KLHDC4Q8TBB5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KLHDC4Q8TBB5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KLHDC4Q8TBB5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
KLHDC4Q8TBB5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KLHDC4Q8TBB5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KLHDC4Q8TBB5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KLHDC4Q8TBB5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KLHDC4Q8TBB5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KLHDC4Q8TBB5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KLHDC4Q8TBB5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
KLHDC4Q8TBB5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KLHDC4Q8TBB5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KLHDC4Q8TBB5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KLHDC4Q8TBB5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KLHDC4Q8TBB5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KLHDC4Q8TBB5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KLHDC4Q8TBB5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KLHDC4Q8TBB5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KLHDC4Q8TBB5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KLHDC4Q8TBB5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KLHDC4Q8TBB5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KLHDC4Q8TBB5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KLHDC4Q8TBB5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KLHDC4Q8TBB5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KLHDC4Q8TBB5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KLHDC4Q8TBB5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms