Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATL2Q8NHH9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATL2Q8NHH9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATL2Q8NHH9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATL2Q8NHH9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATL2Q8NHH9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATL2Q8NHH9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATL2Q8NHH9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATL2Q8NHH9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATL2Q8NHH9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATL2Q8NHH9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATL2Q8NHH9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATL2Q8NHH9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATL2Q8NHH9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATL2Q8NHH9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATL2Q8NHH9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATL2Q8NHH9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATL2Q8NHH9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATL2Q8NHH9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATL2Q8NHH9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATL2Q8NHH9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATL2Q8NHH9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATL2Q8NHH9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATL2Q8NHH9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATL2Q8NHH9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATL2Q8NHH9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATL2Q8NHH9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATL2Q8NHH9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ATL2Q8NHH9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATL2Q8NHH9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATL2Q8NHH9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATL2Q8NHH9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATL2Q8NHH9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATL2Q8NHH9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATL2Q8NHH9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATL2Q8NHH9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ATL2Q8NHH9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATL2Q8NHH9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ATL2Q8NHH9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATL2Q8NHH9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATL2Q8NHH9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATL2Q8NHH9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATL2Q8NHH9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATL2Q8NHH9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATL2Q8NHH9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ATL2Q8NHH9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATL2Q8NHH9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATL2Q8NHH9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATL2Q8NHH9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATL2Q8NHH9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATL2Q8NHH9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATL2Q8NHH9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATL2Q8NHH9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATL2Q8NHH9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATL2Q8NHH9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATL2Q8NHH9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATL2Q8NHH9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATL2Q8NHH9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATL2Q8NHH9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATL2Q8NHH9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATL2Q8NHH9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ATL2Q8NHH9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATL2Q8NHH9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATL2Q8NHH9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATL2Q8NHH9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ATL2Q8NHH9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATL2Q8NHH9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATL2Q8NHH9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATL2Q8NHH9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATL2Q8NHH9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATL2Q8NHH9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATL2Q8NHH9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATL2Q8NHH9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATL2Q8NHH9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ATL2Q8NHH9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ATL2Q8NHH9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATL2Q8NHH9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATL2Q8NHH9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATL2Q8NHH9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATL2Q8NHH9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATL2Q8NHH9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATL2Q8NHH9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATL2Q8NHH9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATL2Q8NHH9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATL2Q8NHH9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATL2Q8NHH9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATL2Q8NHH9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATL2Q8NHH9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATL2Q8NHH9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATL2Q8NHH9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATL2Q8NHH9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATL2Q8NHH9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATL2Q8NHH9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATL2Q8NHH9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATL2Q8NHH9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATL2Q8NHH9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATL2Q8NHH9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATL2Q8NHH9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ATL2Q8NHH9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATL2Q8NHH9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms