Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM8

AGBL3, Cytosolic carboxypeptidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGBL3Q8NEM8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
AGBL3Q8NEM8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
AGBL3Q8NEM8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
AGBL3Q8NEM8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
AGBL3Q8NEM8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
AGBL3Q8NEM8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
AGBL3Q8NEM8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
AGBL3Q8NEM8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
AGBL3Q8NEM8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
AGBL3Q8NEM8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
AGBL3Q8NEM8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
AGBL3Q8NEM8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
AGBL3Q8NEM8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
AGBL3Q8NEM8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
AGBL3Q8NEM8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
AGBL3Q8NEM8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
AGBL3Q8NEM8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
AGBL3Q8NEM8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
AGBL3Q8NEM8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
AGBL3Q8NEM8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
AGBL3Q8NEM8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
AGBL3Q8NEM8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
AGBL3Q8NEM8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
AGBL3Q8NEM8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
AGBL3Q8NEM8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
AGBL3Q8NEM8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
AGBL3Q8NEM8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
AGBL3Q8NEM8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
AGBL3Q8NEM8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
AGBL3Q8NEM8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
AGBL3Q8NEM8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
AGBL3Q8NEM8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
AGBL3Q8NEM8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
AGBL3Q8NEM8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
AGBL3Q8NEM8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
AGBL3Q8NEM8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
AGBL3Q8NEM8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
AGBL3Q8NEM8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
AGBL3Q8NEM8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
AGBL3Q8NEM8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
AGBL3Q8NEM8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
AGBL3Q8NEM8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
AGBL3Q8NEM8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
AGBL3Q8NEM8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
AGBL3Q8NEM8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
AGBL3Q8NEM8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
AGBL3Q8NEM8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
AGBL3Q8NEM8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
AGBL3Q8NEM8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
AGBL3Q8NEM8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
AGBL3Q8NEM8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
AGBL3Q8NEM8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
AGBL3Q8NEM8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
AGBL3Q8NEM8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
AGBL3Q8NEM8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
AGBL3Q8NEM8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
AGBL3Q8NEM8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
AGBL3Q8NEM8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
AGBL3Q8NEM8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
AGBL3Q8NEM8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
AGBL3Q8NEM8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
AGBL3Q8NEM8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
AGBL3Q8NEM8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
AGBL3Q8NEM8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
AGBL3Q8NEM8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
AGBL3Q8NEM8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.55■■■□□ 2
AGBL3Q8NEM8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
AGBL3Q8NEM8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
AGBL3Q8NEM8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
AGBL3Q8NEM8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
AGBL3Q8NEM8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
AGBL3Q8NEM8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
AGBL3Q8NEM8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.54■■■□□ 2
AGBL3Q8NEM8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
AGBL3Q8NEM8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
AGBL3Q8NEM8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
AGBL3Q8NEM8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
AGBL3Q8NEM8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
AGBL3Q8NEM8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
AGBL3Q8NEM8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
AGBL3Q8NEM8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
AGBL3Q8NEM8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
AGBL3Q8NEM8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
AGBL3Q8NEM8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
AGBL3Q8NEM8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
AGBL3Q8NEM8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
AGBL3Q8NEM8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
AGBL3Q8NEM8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
AGBL3Q8NEM8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
AGBL3Q8NEM8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
AGBL3Q8NEM8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
AGBL3Q8NEM8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
AGBL3Q8NEM8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
AGBL3Q8NEM8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
AGBL3Q8NEM8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
AGBL3Q8NEM8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
AGBL3Q8NEM8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
AGBL3Q8NEM8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
AGBL3Q8NEM8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
AGBL3Q8NEM8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms