Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCN5

PDPR, Pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDPRQ8NCN5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDPRQ8NCN5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDPRQ8NCN5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDPRQ8NCN5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDPRQ8NCN5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDPRQ8NCN5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDPRQ8NCN5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDPRQ8NCN5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDPRQ8NCN5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDPRQ8NCN5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDPRQ8NCN5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDPRQ8NCN5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PDPRQ8NCN5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PDPRQ8NCN5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDPRQ8NCN5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDPRQ8NCN5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDPRQ8NCN5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDPRQ8NCN5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDPRQ8NCN5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDPRQ8NCN5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDPRQ8NCN5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDPRQ8NCN5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDPRQ8NCN5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDPRQ8NCN5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PDPRQ8NCN5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PDPRQ8NCN5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDPRQ8NCN5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDPRQ8NCN5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDPRQ8NCN5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDPRQ8NCN5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDPRQ8NCN5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDPRQ8NCN5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDPRQ8NCN5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PDPRQ8NCN5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDPRQ8NCN5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDPRQ8NCN5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDPRQ8NCN5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDPRQ8NCN5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDPRQ8NCN5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDPRQ8NCN5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDPRQ8NCN5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDPRQ8NCN5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDPRQ8NCN5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDPRQ8NCN5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDPRQ8NCN5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDPRQ8NCN5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDPRQ8NCN5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDPRQ8NCN5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDPRQ8NCN5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDPRQ8NCN5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PDPRQ8NCN5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDPRQ8NCN5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDPRQ8NCN5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDPRQ8NCN5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDPRQ8NCN5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDPRQ8NCN5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDPRQ8NCN5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDPRQ8NCN5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDPRQ8NCN5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDPRQ8NCN5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDPRQ8NCN5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDPRQ8NCN5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDPRQ8NCN5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDPRQ8NCN5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDPRQ8NCN5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDPRQ8NCN5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDPRQ8NCN5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDPRQ8NCN5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDPRQ8NCN5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDPRQ8NCN5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDPRQ8NCN5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PDPRQ8NCN5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDPRQ8NCN5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDPRQ8NCN5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDPRQ8NCN5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDPRQ8NCN5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDPRQ8NCN5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDPRQ8NCN5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDPRQ8NCN5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDPRQ8NCN5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDPRQ8NCN5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PDPRQ8NCN5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDPRQ8NCN5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDPRQ8NCN5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDPRQ8NCN5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDPRQ8NCN5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDPRQ8NCN5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDPRQ8NCN5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDPRQ8NCN5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDPRQ8NCN5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDPRQ8NCN5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDPRQ8NCN5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDPRQ8NCN5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDPRQ8NCN5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDPRQ8NCN5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDPRQ8NCN5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDPRQ8NCN5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDPRQ8NCN5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDPRQ8NCN5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDPRQ8NCN5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms