Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC42

RNF149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF149Q8NC42 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF149Q8NC42 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF149Q8NC42 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF149Q8NC42 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF149Q8NC42 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF149Q8NC42 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF149Q8NC42 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF149Q8NC42 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF149Q8NC42 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF149Q8NC42 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF149Q8NC42 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF149Q8NC42 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF149Q8NC42 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF149Q8NC42 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF149Q8NC42 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF149Q8NC42 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF149Q8NC42 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF149Q8NC42 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF149Q8NC42 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF149Q8NC42 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF149Q8NC42 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF149Q8NC42 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF149Q8NC42 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF149Q8NC42 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF149Q8NC42 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF149Q8NC42 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF149Q8NC42 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF149Q8NC42 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF149Q8NC42 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF149Q8NC42 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF149Q8NC42 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF149Q8NC42 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF149Q8NC42 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF149Q8NC42 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF149Q8NC42 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF149Q8NC42 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF149Q8NC42 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF149Q8NC42 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF149Q8NC42 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF149Q8NC42 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF149Q8NC42 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF149Q8NC42 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF149Q8NC42 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF149Q8NC42 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF149Q8NC42 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF149Q8NC42 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF149Q8NC42 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF149Q8NC42 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF149Q8NC42 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF149Q8NC42 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF149Q8NC42 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF149Q8NC42 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF149Q8NC42 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF149Q8NC42 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF149Q8NC42 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF149Q8NC42 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF149Q8NC42 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF149Q8NC42 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF149Q8NC42 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF149Q8NC42 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF149Q8NC42 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF149Q8NC42 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF149Q8NC42 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF149Q8NC42 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF149Q8NC42 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF149Q8NC42 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF149Q8NC42 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF149Q8NC42 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF149Q8NC42 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF149Q8NC42 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF149Q8NC42 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF149Q8NC42 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF149Q8NC42 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF149Q8NC42 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF149Q8NC42 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF149Q8NC42 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF149Q8NC42 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF149Q8NC42 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF149Q8NC42 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF149Q8NC42 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF149Q8NC42 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF149Q8NC42 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF149Q8NC42 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF149Q8NC42 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF149Q8NC42 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF149Q8NC42 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF149Q8NC42 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF149Q8NC42 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF149Q8NC42 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF149Q8NC42 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF149Q8NC42 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF149Q8NC42 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF149Q8NC42 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF149Q8NC42 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF149Q8NC42 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF149Q8NC42 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF149Q8NC42 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF149Q8NC42 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF149Q8NC42 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF149Q8NC42 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms