Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBD8

TMEM229B, Transmembrane protein 229B, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM229BQ8NBD8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM229BQ8NBD8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM229BQ8NBD8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM229BQ8NBD8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM229BQ8NBD8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM229BQ8NBD8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM229BQ8NBD8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM229BQ8NBD8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM229BQ8NBD8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM229BQ8NBD8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM229BQ8NBD8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM229BQ8NBD8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM229BQ8NBD8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM229BQ8NBD8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM229BQ8NBD8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM229BQ8NBD8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TMEM229BQ8NBD8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TMEM229BQ8NBD8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMEM229BQ8NBD8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMEM229BQ8NBD8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMEM229BQ8NBD8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMEM229BQ8NBD8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMEM229BQ8NBD8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMEM229BQ8NBD8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMEM229BQ8NBD8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TMEM229BQ8NBD8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMEM229BQ8NBD8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMEM229BQ8NBD8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMEM229BQ8NBD8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMEM229BQ8NBD8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM229BQ8NBD8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM229BQ8NBD8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM229BQ8NBD8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM229BQ8NBD8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM229BQ8NBD8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM229BQ8NBD8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM229BQ8NBD8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM229BQ8NBD8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM229BQ8NBD8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM229BQ8NBD8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM229BQ8NBD8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM229BQ8NBD8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM229BQ8NBD8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM229BQ8NBD8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM229BQ8NBD8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM229BQ8NBD8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM229BQ8NBD8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM229BQ8NBD8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM229BQ8NBD8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM229BQ8NBD8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM229BQ8NBD8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM229BQ8NBD8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM229BQ8NBD8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM229BQ8NBD8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM229BQ8NBD8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM229BQ8NBD8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM229BQ8NBD8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM229BQ8NBD8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM229BQ8NBD8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM229BQ8NBD8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM229BQ8NBD8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM229BQ8NBD8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM229BQ8NBD8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM229BQ8NBD8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM229BQ8NBD8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM229BQ8NBD8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM229BQ8NBD8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM229BQ8NBD8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM229BQ8NBD8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM229BQ8NBD8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM229BQ8NBD8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM229BQ8NBD8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM229BQ8NBD8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM229BQ8NBD8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM229BQ8NBD8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM229BQ8NBD8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM229BQ8NBD8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM229BQ8NBD8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM229BQ8NBD8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM229BQ8NBD8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM229BQ8NBD8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM229BQ8NBD8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM229BQ8NBD8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM229BQ8NBD8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM229BQ8NBD8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM229BQ8NBD8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM229BQ8NBD8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM229BQ8NBD8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM229BQ8NBD8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM229BQ8NBD8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM229BQ8NBD8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM229BQ8NBD8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM229BQ8NBD8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM229BQ8NBD8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM229BQ8NBD8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM229BQ8NBD8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM229BQ8NBD8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM229BQ8NBD8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM229BQ8NBD8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM229BQ8NBD8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms