Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC63Q8NA47 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC63Q8NA47 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC63Q8NA47 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC63Q8NA47 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC63Q8NA47 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC63Q8NA47 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC63Q8NA47 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC63Q8NA47 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC63Q8NA47 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC63Q8NA47 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC63Q8NA47 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC63Q8NA47 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC63Q8NA47 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC63Q8NA47 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC63Q8NA47 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC63Q8NA47 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC63Q8NA47 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC63Q8NA47 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC63Q8NA47 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC63Q8NA47 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC63Q8NA47 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC63Q8NA47 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC63Q8NA47 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC63Q8NA47 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC63Q8NA47 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC63Q8NA47 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC63Q8NA47 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC63Q8NA47 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC63Q8NA47 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC63Q8NA47 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC63Q8NA47 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC63Q8NA47 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC63Q8NA47 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC63Q8NA47 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC63Q8NA47 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC63Q8NA47 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC63Q8NA47 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC63Q8NA47 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC63Q8NA47 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC63Q8NA47 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC63Q8NA47 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC63Q8NA47 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC63Q8NA47 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC63Q8NA47 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC63Q8NA47 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC63Q8NA47 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC63Q8NA47 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC63Q8NA47 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC63Q8NA47 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC63Q8NA47 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC63Q8NA47 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC63Q8NA47 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC63Q8NA47 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC63Q8NA47 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC63Q8NA47 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC63Q8NA47 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC63Q8NA47 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC63Q8NA47 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC63Q8NA47 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC63Q8NA47 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC63Q8NA47 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC63Q8NA47 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC63Q8NA47 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC63Q8NA47 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC63Q8NA47 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC63Q8NA47 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC63Q8NA47 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC63Q8NA47 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC63Q8NA47 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC63Q8NA47 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC63Q8NA47 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC63Q8NA47 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC63Q8NA47 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC63Q8NA47 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC63Q8NA47 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC63Q8NA47 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC63Q8NA47 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC63Q8NA47 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC63Q8NA47 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC63Q8NA47 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC63Q8NA47 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC63Q8NA47 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC63Q8NA47 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC63Q8NA47 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC63Q8NA47 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC63Q8NA47 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC63Q8NA47 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC63Q8NA47 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC63Q8NA47 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC63Q8NA47 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC63Q8NA47 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC63Q8NA47 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC63Q8NA47 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC63Q8NA47 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC63Q8NA47 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC63Q8NA47 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC63Q8NA47 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC63Q8NA47 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC63Q8NA47 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms