Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZIC4Q8N9L1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZIC4Q8N9L1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZIC4Q8N9L1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZIC4Q8N9L1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZIC4Q8N9L1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZIC4Q8N9L1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZIC4Q8N9L1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZIC4Q8N9L1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZIC4Q8N9L1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ZIC4Q8N9L1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ZIC4Q8N9L1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZIC4Q8N9L1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZIC4Q8N9L1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZIC4Q8N9L1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZIC4Q8N9L1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZIC4Q8N9L1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZIC4Q8N9L1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZIC4Q8N9L1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZIC4Q8N9L1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZIC4Q8N9L1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZIC4Q8N9L1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZIC4Q8N9L1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZIC4Q8N9L1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ZIC4Q8N9L1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZIC4Q8N9L1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZIC4Q8N9L1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZIC4Q8N9L1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZIC4Q8N9L1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZIC4Q8N9L1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZIC4Q8N9L1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZIC4Q8N9L1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZIC4Q8N9L1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZIC4Q8N9L1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZIC4Q8N9L1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZIC4Q8N9L1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZIC4Q8N9L1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZIC4Q8N9L1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ZIC4Q8N9L1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZIC4Q8N9L1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZIC4Q8N9L1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZIC4Q8N9L1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZIC4Q8N9L1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZIC4Q8N9L1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZIC4Q8N9L1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZIC4Q8N9L1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZIC4Q8N9L1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZIC4Q8N9L1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZIC4Q8N9L1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZIC4Q8N9L1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZIC4Q8N9L1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZIC4Q8N9L1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZIC4Q8N9L1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZIC4Q8N9L1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZIC4Q8N9L1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZIC4Q8N9L1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZIC4Q8N9L1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZIC4Q8N9L1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ZIC4Q8N9L1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZIC4Q8N9L1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZIC4Q8N9L1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZIC4Q8N9L1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZIC4Q8N9L1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZIC4Q8N9L1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZIC4Q8N9L1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ZIC4Q8N9L1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZIC4Q8N9L1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZIC4Q8N9L1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZIC4Q8N9L1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZIC4Q8N9L1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZIC4Q8N9L1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZIC4Q8N9L1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZIC4Q8N9L1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZIC4Q8N9L1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZIC4Q8N9L1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZIC4Q8N9L1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZIC4Q8N9L1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZIC4Q8N9L1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZIC4Q8N9L1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZIC4Q8N9L1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZIC4Q8N9L1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZIC4Q8N9L1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZIC4Q8N9L1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZIC4Q8N9L1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ZIC4Q8N9L1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ZIC4Q8N9L1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ZIC4Q8N9L1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ZIC4Q8N9L1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZIC4Q8N9L1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZIC4Q8N9L1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZIC4Q8N9L1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZIC4Q8N9L1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZIC4Q8N9L1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZIC4Q8N9L1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZIC4Q8N9L1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZIC4Q8N9L1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZIC4Q8N9L1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZIC4Q8N9L1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZIC4Q8N9L1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZIC4Q8N9L1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms