Protein–RNA interactions for Protein: Q8N945

PRELID2, PRELI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID2Q8N945 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRELID2Q8N945 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRELID2Q8N945 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRELID2Q8N945 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRELID2Q8N945 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRELID2Q8N945 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRELID2Q8N945 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRELID2Q8N945 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRELID2Q8N945 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRELID2Q8N945 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRELID2Q8N945 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRELID2Q8N945 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRELID2Q8N945 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRELID2Q8N945 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRELID2Q8N945 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRELID2Q8N945 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRELID2Q8N945 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRELID2Q8N945 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRELID2Q8N945 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRELID2Q8N945 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRELID2Q8N945 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRELID2Q8N945 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRELID2Q8N945 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRELID2Q8N945 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PRELID2Q8N945 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRELID2Q8N945 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRELID2Q8N945 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRELID2Q8N945 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRELID2Q8N945 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRELID2Q8N945 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRELID2Q8N945 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRELID2Q8N945 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRELID2Q8N945 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRELID2Q8N945 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PRELID2Q8N945 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRELID2Q8N945 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRELID2Q8N945 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRELID2Q8N945 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRELID2Q8N945 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRELID2Q8N945 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRELID2Q8N945 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRELID2Q8N945 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRELID2Q8N945 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRELID2Q8N945 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRELID2Q8N945 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PRELID2Q8N945 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRELID2Q8N945 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRELID2Q8N945 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRELID2Q8N945 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRELID2Q8N945 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRELID2Q8N945 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRELID2Q8N945 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRELID2Q8N945 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRELID2Q8N945 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRELID2Q8N945 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRELID2Q8N945 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRELID2Q8N945 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRELID2Q8N945 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRELID2Q8N945 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRELID2Q8N945 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRELID2Q8N945 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRELID2Q8N945 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRELID2Q8N945 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRELID2Q8N945 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRELID2Q8N945 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRELID2Q8N945 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRELID2Q8N945 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRELID2Q8N945 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRELID2Q8N945 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PRELID2Q8N945 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRELID2Q8N945 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRELID2Q8N945 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PRELID2Q8N945 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRELID2Q8N945 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRELID2Q8N945 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRELID2Q8N945 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRELID2Q8N945 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRELID2Q8N945 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRELID2Q8N945 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRELID2Q8N945 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRELID2Q8N945 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PRELID2Q8N945 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRELID2Q8N945 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRELID2Q8N945 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRELID2Q8N945 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRELID2Q8N945 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRELID2Q8N945 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRELID2Q8N945 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRELID2Q8N945 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRELID2Q8N945 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRELID2Q8N945 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRELID2Q8N945 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRELID2Q8N945 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRELID2Q8N945 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRELID2Q8N945 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRELID2Q8N945 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRELID2Q8N945 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PRELID2Q8N945 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRELID2Q8N945 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRELID2Q8N945 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms