Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7E2

ZNF645, E3 ubiquitin-protein ligase ZNF645, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF645Q8N7E2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF645Q8N7E2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF645Q8N7E2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF645Q8N7E2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF645Q8N7E2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF645Q8N7E2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF645Q8N7E2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF645Q8N7E2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF645Q8N7E2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF645Q8N7E2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF645Q8N7E2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF645Q8N7E2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF645Q8N7E2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF645Q8N7E2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF645Q8N7E2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF645Q8N7E2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF645Q8N7E2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ZNF645Q8N7E2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ZNF645Q8N7E2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF645Q8N7E2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF645Q8N7E2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF645Q8N7E2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF645Q8N7E2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF645Q8N7E2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF645Q8N7E2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF645Q8N7E2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF645Q8N7E2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF645Q8N7E2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF645Q8N7E2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF645Q8N7E2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF645Q8N7E2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF645Q8N7E2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF645Q8N7E2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF645Q8N7E2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF645Q8N7E2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF645Q8N7E2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF645Q8N7E2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF645Q8N7E2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF645Q8N7E2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF645Q8N7E2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF645Q8N7E2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF645Q8N7E2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF645Q8N7E2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF645Q8N7E2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF645Q8N7E2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF645Q8N7E2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF645Q8N7E2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF645Q8N7E2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF645Q8N7E2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF645Q8N7E2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF645Q8N7E2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF645Q8N7E2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF645Q8N7E2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF645Q8N7E2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF645Q8N7E2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF645Q8N7E2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF645Q8N7E2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF645Q8N7E2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF645Q8N7E2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF645Q8N7E2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF645Q8N7E2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF645Q8N7E2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF645Q8N7E2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF645Q8N7E2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF645Q8N7E2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF645Q8N7E2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF645Q8N7E2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF645Q8N7E2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF645Q8N7E2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF645Q8N7E2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF645Q8N7E2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF645Q8N7E2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF645Q8N7E2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF645Q8N7E2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF645Q8N7E2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF645Q8N7E2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF645Q8N7E2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF645Q8N7E2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF645Q8N7E2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF645Q8N7E2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF645Q8N7E2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF645Q8N7E2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF645Q8N7E2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF645Q8N7E2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF645Q8N7E2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF645Q8N7E2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF645Q8N7E2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF645Q8N7E2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF645Q8N7E2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF645Q8N7E2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF645Q8N7E2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF645Q8N7E2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF645Q8N7E2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF645Q8N7E2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF645Q8N7E2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF645Q8N7E2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF645Q8N7E2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF645Q8N7E2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF645Q8N7E2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF645Q8N7E2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms