Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDCL2Q8N4E4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDCL2Q8N4E4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDCL2Q8N4E4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDCL2Q8N4E4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PDCL2Q8N4E4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDCL2Q8N4E4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDCL2Q8N4E4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDCL2Q8N4E4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDCL2Q8N4E4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDCL2Q8N4E4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDCL2Q8N4E4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PDCL2Q8N4E4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDCL2Q8N4E4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDCL2Q8N4E4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDCL2Q8N4E4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDCL2Q8N4E4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDCL2Q8N4E4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDCL2Q8N4E4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDCL2Q8N4E4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDCL2Q8N4E4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDCL2Q8N4E4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDCL2Q8N4E4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDCL2Q8N4E4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDCL2Q8N4E4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDCL2Q8N4E4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDCL2Q8N4E4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDCL2Q8N4E4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDCL2Q8N4E4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDCL2Q8N4E4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDCL2Q8N4E4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDCL2Q8N4E4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDCL2Q8N4E4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDCL2Q8N4E4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDCL2Q8N4E4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PDCL2Q8N4E4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PDCL2Q8N4E4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDCL2Q8N4E4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDCL2Q8N4E4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDCL2Q8N4E4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDCL2Q8N4E4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDCL2Q8N4E4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDCL2Q8N4E4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDCL2Q8N4E4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDCL2Q8N4E4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDCL2Q8N4E4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDCL2Q8N4E4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDCL2Q8N4E4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDCL2Q8N4E4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDCL2Q8N4E4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDCL2Q8N4E4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDCL2Q8N4E4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDCL2Q8N4E4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDCL2Q8N4E4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDCL2Q8N4E4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDCL2Q8N4E4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDCL2Q8N4E4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDCL2Q8N4E4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDCL2Q8N4E4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDCL2Q8N4E4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDCL2Q8N4E4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDCL2Q8N4E4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDCL2Q8N4E4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDCL2Q8N4E4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDCL2Q8N4E4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDCL2Q8N4E4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDCL2Q8N4E4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDCL2Q8N4E4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDCL2Q8N4E4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDCL2Q8N4E4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDCL2Q8N4E4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDCL2Q8N4E4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDCL2Q8N4E4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDCL2Q8N4E4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDCL2Q8N4E4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDCL2Q8N4E4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PDCL2Q8N4E4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PDCL2Q8N4E4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDCL2Q8N4E4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDCL2Q8N4E4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDCL2Q8N4E4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDCL2Q8N4E4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDCL2Q8N4E4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PDCL2Q8N4E4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDCL2Q8N4E4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDCL2Q8N4E4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDCL2Q8N4E4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDCL2Q8N4E4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDCL2Q8N4E4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDCL2Q8N4E4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDCL2Q8N4E4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PDCL2Q8N4E4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDCL2Q8N4E4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDCL2Q8N4E4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDCL2Q8N4E4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDCL2Q8N4E4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDCL2Q8N4E4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDCL2Q8N4E4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDCL2Q8N4E4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDCL2Q8N4E4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms