Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.38
VPS8Q8N3P4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.38
VPS8Q8N3P4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.38
VPS8Q8N3P4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
VPS8Q8N3P4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.38
VPS8Q8N3P4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC36.2■■■■□ 3.38
VPS8Q8N3P4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
VPS8Q8N3P4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
VPS8Q8N3P4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
VPS8Q8N3P4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
VPS8Q8N3P4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
VPS8Q8N3P4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
VPS8Q8N3P4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
VPS8Q8N3P4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
VPS8Q8N3P4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
VPS8Q8N3P4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
VPS8Q8N3P4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
VPS8Q8N3P4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
VPS8Q8N3P4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
VPS8Q8N3P4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
VPS8Q8N3P4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
VPS8Q8N3P4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
VPS8Q8N3P4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
VPS8Q8N3P4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
VPS8Q8N3P4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
VPS8Q8N3P4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
VPS8Q8N3P4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
VPS8Q8N3P4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
VPS8Q8N3P4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
VPS8Q8N3P4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
VPS8Q8N3P4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
VPS8Q8N3P4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
VPS8Q8N3P4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
VPS8Q8N3P4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
VPS8Q8N3P4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
VPS8Q8N3P4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
VPS8Q8N3P4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
VPS8Q8N3P4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
VPS8Q8N3P4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
VPS8Q8N3P4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
VPS8Q8N3P4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
VPS8Q8N3P4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
VPS8Q8N3P4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
VPS8Q8N3P4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
VPS8Q8N3P4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
VPS8Q8N3P4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
VPS8Q8N3P4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
VPS8Q8N3P4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
VPS8Q8N3P4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
VPS8Q8N3P4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
VPS8Q8N3P4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
VPS8Q8N3P4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
VPS8Q8N3P4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
VPS8Q8N3P4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
VPS8Q8N3P4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
VPS8Q8N3P4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
VPS8Q8N3P4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
VPS8Q8N3P4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
VPS8Q8N3P4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
VPS8Q8N3P4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
VPS8Q8N3P4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
VPS8Q8N3P4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
VPS8Q8N3P4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
VPS8Q8N3P4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
VPS8Q8N3P4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
VPS8Q8N3P4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
VPS8Q8N3P4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
VPS8Q8N3P4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
VPS8Q8N3P4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
VPS8Q8N3P4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
VPS8Q8N3P4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
VPS8Q8N3P4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
VPS8Q8N3P4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
VPS8Q8N3P4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC36.08■■■■□ 3.37
VPS8Q8N3P4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
VPS8Q8N3P4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
VPS8Q8N3P4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
VPS8Q8N3P4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
VPS8Q8N3P4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
VPS8Q8N3P4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
VPS8Q8N3P4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
VPS8Q8N3P4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
VPS8Q8N3P4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
VPS8Q8N3P4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
VPS8Q8N3P4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
VPS8Q8N3P4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
VPS8Q8N3P4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
VPS8Q8N3P4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
VPS8Q8N3P4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
VPS8Q8N3P4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
VPS8Q8N3P4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
VPS8Q8N3P4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
VPS8Q8N3P4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
VPS8Q8N3P4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
VPS8Q8N3P4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
VPS8Q8N3P4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
VPS8Q8N3P4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
VPS8Q8N3P4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
VPS8Q8N3P4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
VPS8Q8N3P4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms