Protein–RNA interactions for Protein: Q8N271

PROM2, Prominin-2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM2Q8N271 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PROM2Q8N271 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PROM2Q8N271 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PROM2Q8N271 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
PROM2Q8N271 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PROM2Q8N271 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
PROM2Q8N271 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PROM2Q8N271 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
PROM2Q8N271 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PROM2Q8N271 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PROM2Q8N271 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PROM2Q8N271 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PROM2Q8N271 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
PROM2Q8N271 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
PROM2Q8N271 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PROM2Q8N271 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PROM2Q8N271 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
PROM2Q8N271 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PROM2Q8N271 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PROM2Q8N271 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PROM2Q8N271 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
PROM2Q8N271 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PROM2Q8N271 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PROM2Q8N271 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PROM2Q8N271 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PROM2Q8N271 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PROM2Q8N271 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PROM2Q8N271 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PROM2Q8N271 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PROM2Q8N271 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
PROM2Q8N271 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
PROM2Q8N271 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
PROM2Q8N271 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PROM2Q8N271 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PROM2Q8N271 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PROM2Q8N271 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PROM2Q8N271 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PROM2Q8N271 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PROM2Q8N271 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PROM2Q8N271 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PROM2Q8N271 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PROM2Q8N271 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PROM2Q8N271 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PROM2Q8N271 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PROM2Q8N271 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PROM2Q8N271 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PROM2Q8N271 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PROM2Q8N271 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PROM2Q8N271 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PROM2Q8N271 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PROM2Q8N271 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PROM2Q8N271 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PROM2Q8N271 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PROM2Q8N271 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PROM2Q8N271 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PROM2Q8N271 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PROM2Q8N271 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PROM2Q8N271 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
PROM2Q8N271 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PROM2Q8N271 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PROM2Q8N271 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PROM2Q8N271 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PROM2Q8N271 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PROM2Q8N271 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PROM2Q8N271 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PROM2Q8N271 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PROM2Q8N271 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PROM2Q8N271 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PROM2Q8N271 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PROM2Q8N271 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PROM2Q8N271 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PROM2Q8N271 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PROM2Q8N271 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PROM2Q8N271 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PROM2Q8N271 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PROM2Q8N271 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PROM2Q8N271 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PROM2Q8N271 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PROM2Q8N271 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PROM2Q8N271 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PROM2Q8N271 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PROM2Q8N271 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PROM2Q8N271 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PROM2Q8N271 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PROM2Q8N271 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PROM2Q8N271 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
PROM2Q8N271 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
PROM2Q8N271 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PROM2Q8N271 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PROM2Q8N271 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PROM2Q8N271 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PROM2Q8N271 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PROM2Q8N271 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PROM2Q8N271 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
PROM2Q8N271 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
PROM2Q8N271 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PROM2Q8N271 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PROM2Q8N271 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PROM2Q8N271 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PROM2Q8N271 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms